RNA–Protein interactions for RNA: YNR069C

BSC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene BSC5, Length 1,470 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BSC5	YNR069C	GIS3	Q12418	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	JIP3	O13555	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	CKA2	P19454	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	NAM9	P27929	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	PFS1	P38872	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	ATG18	P43601	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	SRL4	Q03085	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	JID1	Q12350	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	ATG31	Q12421	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	RPB5	P20434	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	RRT12	P25381	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	URA10	P30402	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	NUP2	P32499	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	MCH2	P36032	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	PET8	P38921	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	OXA1	P39952	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	YER085C	P40058	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	YRB2	P40517	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	YAR1	P46683	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	IRC25	Q07951	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	MCT1	Q12283	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	LDS1	P31379	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	PDC2	P32896	925 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	NRM1	P53718	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	MNT4	P53745	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	VBA1	Q04301	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	PAM18	Q07914	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	RIF1	P29539	1916 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	TFS1	P14306	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	DAL81	P21657	970 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	GIT1	P25346	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	YBR241C	P38142	488 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	YAT2	P40017	923 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	MSS2	P40990	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	TIS11	P47977	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	UBC13	P52490	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	VHT1	P53241	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	YGR067C	P53243	804 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	LIP2	Q06005	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BSC5	YNR069C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	CBS2	P14905	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	POF1	P25576	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	TAD2	P47058	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	TPC1	P53257	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	PGA2	P53903	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	VAC7	P53950	1165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	KTR6	P54070	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	CDC14	Q00684	551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	GMC1	Q04399	608 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	INM2	Q05533	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	NNT1	Q05874	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	SNA3	P14359	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	CMK2	P22517	447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	IES6	P32617	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	CYM1	P32898	989 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	MRPL6	P32904	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	PEX31	P53203	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	MRPL50	P53724	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	ECM11	Q04110	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	CTR3	Q06686	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	SFM1	Q12314	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	LDB7	P38210	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	TVP23	P38962	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	TIM17	P39515	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	YER186C	P40101	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BSC5	YNR069C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.4 ms