RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	MET3	P08536	511 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	NFT1	P0CE68	1218 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	HNM1	P19807	563 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	CPR2	P23285	205 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	NTG1	P31378	399 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	VMA11	P32842	164 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ECM8	P38246	354 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YGR168C	P53293	376 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YNL046W	P53956	172 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	BNA7	Q04066	261 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	PEX12	Q04370	399 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YDR514C	Q04408	483 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RIM9	Q04734	239 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ATG26	Q06321	1198 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	SSK1	Q07084	712 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	PSR1	Q07800	427 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	SPC3	Q12133	184 aa		5.52	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	CMK2	P22517	447 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	BUR6	P40096	142 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	FLX1	P40464	311 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	MDE1	P47095	244 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YIP4	P53093	235 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YIP5	P53108	310 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	GET1	P53192	235 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	COS1	P53822	381 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	TIM44	Q01852	431 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	BCP1	Q06338	283 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	TPO3	Q06451	622 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ASA1	Q06822	443 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	TAF3	Q12297	353 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	NKP1	Q12493	238 aa		5.51	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RPL39	P04650	51 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YML003W	P0CF16	290 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	PCL1	P24867	279 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	POL4	P25615	582 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YKL102C	P34249	101 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YBR096W	P38256	230 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	SLZ1	P40167	298 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	PRM15	Q03262	622 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	DLT1	Q04216	342 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	PIN3	Q06449	215 aa		5.5	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	MSW1	P04803	379 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	TFC1	P32367	649 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	SKG1	P36169	355 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RTC2	P38279	296 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	CTR2	P38865	189 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	MLH1	P38920	769 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	IRC5	P43610	853 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	IDS2	P46958	469 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	BNA2	P47125	453 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YGR016W	P53209	190 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ASI2	P53895	289 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YDL114W	Q07530	308 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YLR108C	Q12259	485 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		5.49	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	PDE2	P06776	526 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	DSF1	P0CX08	502 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YNR073C	P0CX09	502 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	BOS1	P25385	244 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	CLG1	P35190	452 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YER184C	P39961	794 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	STB1	P42845	420 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YNL095C	P53932	642 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	APJ1	P53940	528 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	SPR6	Q01684	191 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	NUP49	Q02199	472 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	MSS11	Q03825	758 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	YDR391C	Q04170	232 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	UIP4	Q08926	304 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ACF2	Q12168	779 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	NFI1	Q12216	726 aa		5.48	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	STE18	P18852	110 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	STE50	P25344	346 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	SSY5	P47002	699 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RRN9	P53437	365 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	DSL1	P53847	754 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	ASI3	P53983	676 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	MCH4	Q08268	501 aa		5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
DRE2	YKR071C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.6 ms