RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	GAL3	P13045	520 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	NAS2	P40555	220 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CIS3	P47001	227 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SNX4	P47057	423 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SWC4	P53201	476 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RSM10	Q03201	203 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YML018C	Q03730	393 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	PEX12	Q04370	399 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	APC9	Q12107	265 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	PSY3	Q12318	242 aa		0.2	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SFC1	P33303	322 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.19	□□□□□ -2.38	not detected
BLI1	YKL061W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SDC1	Q03323	175 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CTR3	Q06686	241 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	ERP4	Q12450	207 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YPR064W	Q12492	139 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	IZH4	Q99393	312 aa		0.19	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	PUT1	P09368	476 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YBR220C	P38318	560 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SWC5	P38326	303 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	AIM20	P40451	204 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	TAD2	P47058	250 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YJL028W	P47062	111 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	NIF3	P53081	288 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	DAD3	P69850	94 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	VPS60	Q03390	229 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CSI2	Q08054	341 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SAS5	Q99314	248 aa		0.18	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YGL010W	P25338	174 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SUA5	P32579	426 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YKL063C	P35725	167 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RPC37	P36121	282 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YHI9	P38765	294 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SPT8	P38915	602 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SER33	P40510	469 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	AGX1	P43567	385 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YMR209C	Q03648	457 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CAB5	Q03941	241 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	EMI1	Q04406	187 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	TAF9	Q05027	157 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	DCN1	Q12395	269 aa		0.17	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CCA1	P21269	546 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RNP1	P32385	249 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	DRE2	P36152	348 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YBR219C	P38317	127 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CTR2	P38865	189 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	RCY1	P39531	840 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	IBA57	P47158	497 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CDC14	Q00684	551 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	CYT2	Q00873	224 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	MRPS8	Q03799	155 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	ATC1	Q04005	294 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	PEX10	Q05568	337 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	ASR1	Q06834	288 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YPR1	Q12458	312 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	MHT1	Q12525	324 aa		0.16	□□□□□ -2.38
BLI1	YKL061W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	ATP6	P00854	259 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	MAL32	P38158	584 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	ECM13	P38195	257 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YHL049C	P38722	271 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	YHR022C	P38763	256 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	DOG1	P38774	246 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	TEM1	P38987	245 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	BMT5	P40493	336 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	OST2	P46964	130 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	GTO1	P48239	356 aa		0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
BLI1	YKL061W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39

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