RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C SLY1P22213 666 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C UTR4P32626 227 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RIM2P38127 377 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C LAG1P38703 411 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data3.31□□□□□ -1.88not detected
YKL050CYKL050C PCI8P40512 444 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YGR201CP42936 225 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ALG13P53178 202 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HPF1Q05164 967 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YPR127WQ06494 345 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MFG1Q07684 458 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C THI72Q08579 599 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C IRC13Q08630 104 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SME1Q12330 94 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CDC6P09119 513 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C COS2P0CX12 379 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C COS3P0CX13 379 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MTF1P14908 341 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NUP1P20676 1076 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C QRI5P32344 111 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MST27P53176 234 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SWC4P53201 476 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C PCP1P53259 346 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SNO2P53823 222 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C COG5P53951 403 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TDA6Q06466 467 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SGT1Q08446 395 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C LPX1Q12405 387 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C IDP1P21954 428 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C UBC8P28263 218 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YKL097CP34245 136 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C JEN1P36035 616 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C KAE1P36132 386 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MET30P39014 640 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C AIM23P47015 356 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MAL13P53338 473 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CPR8P53728 308 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NSG2P53898 299 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SSK1Q07084 712 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RPN6Q12377 434 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MGT1P26188 188 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ANR2P36090 516 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YBR241CP38142 488 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C GOS1P38736 223 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.3□□□□□ -1.88 RIP-Chip
YKL050CYKL050C OXA1P39952 402 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C PMT6P42934 759 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C PHB2P50085 310 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SCS3P53012 380 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MRM2P53123 320 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C GPI1P53306 609 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MTM1P53320 366 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YLR152CP54072 576 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CDC14Q00684 551 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C INM2Q05533 292 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ECI1Q05871 280 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CYC7P00045 113 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C CDC8P00572 216 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SPT3P06844 337 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C AAT2P23542 418 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C LST4P34239 828 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C FLO10P36170 1169 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C PAC2P39937 518 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YCH1P42937 148 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SPR6Q01684 191 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C DYN2Q02647 92 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C GRX8Q05926 109 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SFH1Q06168 426 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C MCH4Q08268 501 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SRL2Q12020 392 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TPO4Q12256 659 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C ORT1Q12375 292 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C UTP20P35194 2493 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C BCY1P07278 416 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SEC22P22214 214 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C PMT2P31382 759 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NDT80P38830 627 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C GDS1P41913 522 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C QRI1P43123 477 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C NBP35P52920 328 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C SNX41Q04053 625 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C RDI1Q12434 202 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C Q0144Q9ZZW2 109 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C TFS1P14306 219 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL050CYKL050C HEM15P16622 393 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms