RNA–Protein interactions for RNA: YJL110C

GZF3, Transcript of GATA zinc finger protein, yeast

Gene GZF3, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GZF3	YJL110C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	TMS1	Q12116	473 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	NAM2	P11325	894 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	CPR4	P25334	318 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	AIM29	P36154	155 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	ECM31	P38122	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YBR062C	P38239	180 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YIA6	P40556	373 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	TAD2	P47058	250 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	MST27	P53176	234 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	VAC7	P53950	1165 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	GPI17	Q04080	534 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	GAS2	Q06135	555 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	NDD1	Q08887	554 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	POM33	Q12164	279 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	FRE8	Q12209	686 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	EMP46	Q12396	444 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	PRM4	Q12498	284 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YOR1	P53049	1477 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	PDR12	Q02785	1511 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	PRB1	P09232	635 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	MSI1	P13712	422 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	ERD1	P16151	362 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	PHO13	P19881	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	MCH2	P36032	473 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	BNA7	Q04066	261 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	TAF9	Q05027	157 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	AST1	P35183	429 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
GZF3	YJL110C	YAP3	P38749	330 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YGL260W	P53056	76 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	RMR1	P53060	241 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	NTE1	Q04958	1679 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	CBS2	P14905	389 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	STF2	P16965	84 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	PPA2	P28239	310 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	LDS1	P31379	325 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	HPM1	P40481	377 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	MOB2	P43563	287 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YFR057W	P43625	151 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	VBA1	Q04301	562 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	SPO77	Q06134	477 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	RIF2	Q06208	395 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	SLM3	Q12093	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	SAL1	D6W196	494 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	TFS1	P14306	219 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YAK1	P14680	807 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	INO2	P26798	304 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	NDT80	P38830	627 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	AIM2	P39721	246 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	TIS11	P47977	285 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	UBC13	P52490	153 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	SUR7	P54003	302 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	OST6	Q03723	332 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	FSH2	Q05015	223 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	JID1	Q12350	301 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	GIS3	Q12418	502 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	ARG80	P07249	177 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	NAM9	P27929	486 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	URA10	P30402	227 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	PMT2	P31382	759 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	PDC2	P32896	925 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	MRPL6	P32904	214 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	CLG1	P35190	452 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	CAF4	P36130	643 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	LDB7	P38210	180 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	VMA7	P39111	118 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YER184C	P39961	794 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YIL067C	P40514	678 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	GDS1	P41913	522 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	FMP32	P43557	207 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	SHY1	P53266	389 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GZF3	YJL110C	KTR6	P54070	446 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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