RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	CDC14	Q00684	551 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YMR209C	Q03648	457 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SPO14	P36126	1683 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	DAL81	P21657	970 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	MRPL3	P36516	390 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	MRX5	P47007	382 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	CPD1	P53314	239 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	YML018C	Q03730	393 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	TSC11	P40061	1430 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	SNT2	P53127	1403 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	IRC20	Q06554	1556 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	BUD3	P25558	1636 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	CUP2	P15315	225 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	ATG12	P38316	186 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	COA1	P40452	197 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	YFL064C	P43540	174 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	IBA57	P47158	497 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	UFD1	P53044	361 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	LIF1	P53150	421 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	YPL113C	Q02961	396 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	COX20	Q04935	205 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	IMP1	P28627	190 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	AGA2	P32781	87 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	PRY2	P36110	329 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	AVT7	P40501	490 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	ASG7	P46993	209 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	PEX31	P53203	462 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	ZRG17	P53735	605 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
RPC17	YJL011C	VPS60	Q03390	229 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	GMC2	Q06201	188 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	LOA1	Q06508	300 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	GDB1	Q06625	1536 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	CCH1	P50077	2039 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	POF1	P25576	258 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	SEN34	P39707	275 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	KRE29	P40026	464 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	KAP114	P53067	1004 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	TAF9	Q05027	157 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	ARV1	Q06541	321 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	RRT8	Q08219	342 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	YPL264C	Q08980	353 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	FAB1	P34756	2278 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	COX2	P00410	251 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	PET100	P38958	111 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	YJL118W	P47022	219 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	MRS2	Q01926	470 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	SFH1	Q06168	426 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	YDL144C	Q07589	356 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	CSE1	P33307	960 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	SER33	P40510	469 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	COS4	P43542	379 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	VPS15	P22219	1454 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	NUP159	P40477	1460 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	PHO80	P20052	293 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	AST1	P35183	429 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	YHL044W	P38727	235 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	AVT6	P40074	448 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	OSH6	Q02201	448 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	GTO3	Q04806	366 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPC17	YJL011C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	COT1	P32798	439 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	HSM3	P38348	480 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	PRM9	P39551	298 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	YIL059C	P40520	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	SYS1	P41544	203 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	YAR1	P46683	200 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	SDC1	Q03323	175 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	OST6	Q03723	332 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	SEC10	Q06245	871 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	PDR10	P51533	1564 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPC17	YJL011C	PEX3	P28795	441 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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