RNA–Protein interactions for RNA: YHR085W

IPI1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene IPI1, Length 1,005 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IPI1	YHR085W	SSK1	Q07084	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	CTR86	P25355	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SAS2	P40963	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YGR201C	P42936	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MDV1	P47025	714 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	COS6	P53344	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	DSL1	P53847	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SWP1	Q02795	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RIM13	Q03792	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MSC3	Q05812	728 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SOR2	Q07786	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YRM1	Q12340	786 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PSF1	Q12488	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	KSS1	P14681	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	CTA1	P15202	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YOR062C	P36025	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MED8	P38304	223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	BIG1	P38813	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	GAT2	P40209	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RPE1	P46969	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	FMP33	P46998	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	EKI1	Q03764	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	PHO92	Q06390	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	ARV1	Q06541	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	TMS1	Q12116	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MRX4	Q12467	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	SFG1	Q12507	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IPI1	YHR085W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	PBN1	P25580	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	UBC8	P28263	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	VPS17	P32913	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	NSG1	P38837	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	RCY1	P39531	840 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	SSO2	P39926	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	TAX4	P47030	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YGL260W	P53056	76 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	PKP2	P53170	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	RPN14	P53196	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	NUP53	Q03790	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	GSH2	Q08220	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	RSA1	Q08932	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	MDM32	Q12171	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	FLO9	P39712	1322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	SAG1	P20840	650 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	SEC62	P21825	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	PET18	P25362	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YCR102C	P25608	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	MRPL6	P32904	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	VPS51	P36116	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	GPI16	P38875	610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	COG3	P40094	801 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YIL169C	P40442	995 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	APS3	P47064	194 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	PGU1	P47180	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	NUP57	P48837	541 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	PRM8	P53174	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YLR460C	P54007	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	RRN5	Q02983	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	RSN1	Q03516	953 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	CAC2	Q04199	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	RRI1	Q12468	440 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	SCO1	P23833	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	SPC34	P36131	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	FLO10	P36170	1169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	PEX18	P38855	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	SPO73	P40031	143 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	YRB2	P40517	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	SNL1	P40548	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IPI1	YHR085W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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