RNA–Protein interactions for RNA: YGR246C

BRF1, Transcript of TFIIIB B-related factor, yeast

Gene BRF1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRF1	YGR246C	GAL4	P04386	881 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	KIN28	P06242	306 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PUT1	P09368	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	FUS1	P11710	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PBN1	P25580	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TIM12	P32830	109 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	REC104	P33323	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	MSN4	P33749	630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	EHT1	P38295	451 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YER184C	P39961	794 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	FMP52	P40008	231 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YIL077C	P40508	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SLS1	P42900	643 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YDL183C	P48569	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	JAC1	P53193	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	FHN1	P53279	174 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YNR040W	P53736	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YAP6	Q03935	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SNO4	Q04902	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	HPF1	Q05164	967 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	GAS2	Q06135	555 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	AIM6	Q07716	390 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	HSP32	Q08992	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	REP2	P03872	296 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PPH21	P23594	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PTP1	P25044	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PRO1	P32264	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	GPX1	P36014	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YKL071W	P36086	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	DAD2	P36162	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ANS1	P38832	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	MNL1	P38888	796 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
BRF1	YGR246C	PHO90	P39535	881 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TIR3	P40552	269 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CCC1	P47818	322 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	VHT1	P53241	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SSY1	Q03770	852 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ECM18	Q04623	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	DFG16	Q99234	619 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	FAB1	P34756	2278 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	AI1	P03875	834 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CWH43	P25618	953 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CNE1	P27825	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	NAM9	P27929	486 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	MRP17	P28778	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	VPS51	P36116	164 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	OSH7	P38755	437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SKN7	P38889	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	LRO1	P40345	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SYS1	P41544	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YNR062C	P53748	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TIM44	Q01852	431 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TRM13	Q12383	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	TRS65	P32893	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CHK1	P38147	527 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	ALG14	P38242	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	POP7	P38291	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SDS24	P38314	527 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	RPP1	P38786	293 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	IBA57	P47158	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	INP1	Q03694	420 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	COX20	Q04935	205 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	PRM4	Q12498	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	SET6	Q12529	373 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CHO1	P08456	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YPK2	P18961	677 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	BET2	P20133	325 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	CNB1	P25296	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BRF1	YGR246C	YCR061W	P25639	631 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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