RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	INA22	P40576	216 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	UBC13	P52490	153 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YGR016W	P53209	190 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	OKP1	P53298	406 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	COS6	P53344	381 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	MRS2	Q01926	470 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	SPO77	Q06134	477 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	YPL150W	Q12152	901 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	NFI1	Q12216	726 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	ERP4	Q12450	207 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	DYN1	P36022	4092 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NNF2	YGR089W	RAD7	P06779	565 aa		0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RAD10	P06838	210 aa		0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YHR045W	P38775	560 aa		0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	KRE29	P40026	464 aa		0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	AVT7	P40501	490 aa		0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	STE23	Q06010	1027 aa		0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YLL007C	Q07799	665 aa		0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	EMC6	Q12431	108 aa		0.28	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YOR062C	P36025	268 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	COG3	P40094	801 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	GDS1	P41913	522 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YPL039W	Q03080	316 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TAZ1	Q06510	381 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	VMR1	P38735	1592 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	GAL3	P13045	520 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YCR102C	P25608	368 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	ATG15	P25641	520 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	AEP1	P32493	518 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YDR089W	P38966	869 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CAJ1	P39101	391 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SEN34	P39707	275 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RPE1	P46969	238 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YJL016W	P47072	561 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PSY3	Q12318	242 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	COT1	P32798	439 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	POP8	P38208	133 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	GON7	P46984	123 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SWC4	P53201	476 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YOL019W	Q08157	551 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	APC9	Q12107	265 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YOR114W	Q12219	294 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	ERG2	P32352	222 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PHO89	P38361	574 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YHL026C	P38740	315 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	NAS2	P40555	220 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YML018C	Q03730	393 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	ECM18	Q04623	453 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YPR064W	Q12492	139 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	IZH4	Q99393	312 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	KRE6	P32486	720 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	DOA4	P32571	926 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SWC5	P38326	303 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	ARN2	P38724	620 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	FET3	P38993	636 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	COG7	P53195	279 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	RCF1	Q03713	159 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	DPP1	Q05521	289 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	LOA1	Q06508	300 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	YPL247C	Q12523	523 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	POX1	P13711	748 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	SUA5	P32579	426 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NNF2	YGR089W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37

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