RNA–Protein interactions for RNA: YGR035C

YGR035C, Transcript of Putative protein of unknown function, potential Cdc28p substrate, yeast

Gene YGR035C, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR035C	YGR035C	YHI9	P38765	294 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	GEP5	Q12393	293 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	DAD3	P69850	94 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	YPR1	Q12458	312 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	MHT1	Q12525	324 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	SAS5	Q99314	248 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YGR035C	YGR035C	GAL3	P13045	520 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	POX1	P13711	748 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	HMT1	P38074	348 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	NIF3	P53081	288 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	MDM34	P53083	459 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	AAH1	P53909	347 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YMR209C	Q03648	457 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	DCN1	Q12395	269 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	SUA5	P32579	426 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	FET3	P38993	636 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	PRM15	Q03262	622 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	APC9	Q12107	265 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	CCA1	P21269	546 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YGL010W	P25338	174 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.44	□□□□□ -2.34	not detected
YGR035C	YGR035C	RNP1	P32385	249 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YKL063C	P35725	167 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	DRE2	P36152	348 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	SIF2	P38262	535 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	VPS60	Q03390	229 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	LOA1	Q06508	300 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	NFI1	Q12216	726 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	COS2	P0CX12	379 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	COS3	P0CX13	379 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	PPH21	P23594	369 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	TEM1	P38987	245 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YJL028W	P47062	111 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	TAF9	Q05027	157 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	PST1	Q12355	444 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	RAD3	P06839	778 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	MAL32	P38158	584 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YBR219C	P38317	127 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	YBR220C	P38318	560 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	SWC5	P38326	303 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	MAL12	P53341	584 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	RPC37	P36121	282 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	BMT5	P40493	336 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	AGX1	P43567	385 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	SDC1	Q03323	175 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	BOP2	Q06150	570 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	ASR1	Q06834	288 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	CSI2	Q08054	341 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YGR035C	YGR035C	MDH2	P22133	377 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	PEX4	P29340	183 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	AIM20	P40451	204 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	PRM10	P42946	383 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	YPL077C	Q02831	240 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	RSM10	Q03201	203 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	PSY3	Q12318	242 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	ERP4	Q12450	207 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.39	□□□□□ -2.35	not detected
YGR035C	YGR035C	OST2	P46964	130 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	COX16	P47081	118 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	CYT2	Q00873	224 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	MRPS8	Q03799	155 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	KEL2	P50090	882 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	SIA1	Q12212	622 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	ATO3	Q12359	275 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	DSF1	P0CX08	502 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	YHR022C	P38763	256 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	END3	P39013	349 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	YIA6	P40556	373 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	IBA57	P47158	497 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	GTO1	P48239	356 aa		0.37	□□□□□ -2.35
YGR035C	YGR035C	EMI1	Q04406	187 aa		0.37	□□□□□ -2.35

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