RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	TDA6	Q06466	467 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YOL107W	Q12239	342 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YOL114C	Q12322	202 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SAL1	D6W196	494 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPB5	P20434	215 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	IPT1	P38954	527 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PAC2	P39937	518 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PMT5	P52867	743 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YNL115C	P53925	644 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	NUP100	Q02629	959 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	COQ9	Q05779	260 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	COQ11	Q05892	277 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YLR456W	Q06199	204 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MSB2	P32334	1306 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SAN1	P22470	610 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DCW1	P36091	449 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YFL040W	P43562	540 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	IKS1	P47042	667 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MEP3	P53390	489 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ECT1	P33412	323 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MAC1	P35192	417 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YBR056W	P38081	501 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YHR130C	P38834	111 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	UBP16	Q02863	499 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TMA23	Q03525	211 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	APA2	P22108	325 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YEF1	P32622	495 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GPX2	P38143	162 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ECM34	P38728	170 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	PGA1	P53896	198 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SDH1	Q00711	640 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	not detected
TOM1	YDR457W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	REC104	P33323	182 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SNC2	P33328	115 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GAB1	P41733	394 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HIT1	P46973	164 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YMR206W	Q03695	313 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	MIX14	Q04341	121 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	TMN2	Q04562	672 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ATG39	Q06159	398 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	KEI1	Q06346	221 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ECM30	Q06673	1274 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	IRC19	Q07843	230 aa		2.57	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YCR100C	P25606	316 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	LST4	P34239	828 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	THI80	P35202	319 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	SFK1	P35735	353 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	GTT3	P39996	337 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YER188W	P40103	239 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	CAT5	P41735	233 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	OST3	P48439	350 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	ARG80	P07249	177 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	HXT1	P32465	570 aa		2.56	□□□□□ -2
TOM1	YDR457W	YER085C	P40058	173 aa		2.56	□□□□□ -2

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