RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	DRE2	P36152	348 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	DER1	P38307	211 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SDS24	P38314	527 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SHC1	P39000	512 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	GOR1	P53839	350 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YOL073C	Q08232	322 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	JEN1	P36035	616 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	CAF4	P36130	643 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YBP1	P38315	674 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	COG3	P40094	801 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SFH5	P47008	294 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	PHO23	P50947	330 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	MMS2	P53152	137 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	RPN6	Q12377	434 aa		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.65	□□□□□ -1.82	not detected
SYF1	YDR416W	CPR3	P25719	182 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	SPC34	P36131	295 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YBR096W	P38256	230 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	NDT80	P38830	627 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YIL169C	P40442	995 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	DFG10	P40526	253 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YGL235W	P53071	178 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	PEX31	P53203	462 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	IBD2	P53892	351 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	IRC15	Q02733	499 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	TAZ1	Q06510	381 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	HEM25	Q07534	307 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	HNT3	Q08702	217 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	MUM3	Q08750	479 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	DDC1	Q08949	612 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	ICT1	Q12385	394 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	EMP46	Q12396	444 aa		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	YDR416W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	SPT3	P06844	337 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	PMT2	P31382	759 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	ELM1	P32801	640 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	VRG4	P40107	337 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	JAC1	P53193	184 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	VHT1	P53241	593 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	NRK1	P53915	240 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	ARK1	P53974	638 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YLR152C	P54072	576 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	DXO1	Q06349	442 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	NSL1	Q12143	216 aa		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	CPT1	P17898	393 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YMC1	P32331	307 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	TOD6	P34219	525 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.64	□□□□□ -1.83	not detected
SYF1	YDR416W	AIM23	P47015	356 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	BCH1	Q05029	724 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	PFA4	Q12006	378 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	ATG12	P38316	186 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YNL320W	P42840	284 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	OST3	P48439	350 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	SBH2	P52871	88 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	GTR2	P53290	341 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	NUP49	Q02199	472 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	RIF2	Q06208	395 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	RSA1	Q08932	381 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YLR053C	Q12026	108 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	MST28	P39552	234 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YJL016W	P47072	561 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	ECL1	P48235	211 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	TRM9	P49957	279 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	BRR6	P53062	197 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YNR066C	P53752	436 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	SPC24	Q04477	213 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	FIG2	P25653	1609 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	SIR4	P11978	1358 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	PHO80	P20052	293 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	ECM13	P38195	257 aa		3.63	□□□□□ -1.83

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