RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637243.1

CHRNA4-218, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 85 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-218ENST00000637243 BACH1O14867 736 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 TGM5O43548 720 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF623O75123 536 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GLUD1P00367 558 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 RETP07949 1114 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 TPM2P07951 284 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 RXRAP19793 462 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GJB2P29033 226 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 PRKCQQ04759 706 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ST3GAL1Q11201 340 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CSRP2Q16527 193 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 PALB2Q86YC2 1186 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 MBOAT7Q96N66 472 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ANO3Q9BYT9 981 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CHST7Q9NS84 486 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 NCANO14594 1321 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 A0A087WZ62 844 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 E7EWF7 191 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 LRP3O75074 770 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CAVIN2O95810 425 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 FSHRP23945 695 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SMARCA1P28370 1054 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SREBF1P36956 1147 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 KRT85P78386 507 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SATB1Q01826 763 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 DSG1Q02413 1049 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 DSC1Q08554 894 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 FUT2Q10981 343 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CCDC6Q16204 474 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ME3Q16798 604 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ATL3Q6DD88 541 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 KSR1Q8IVT5 923 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 STAMQ92783 540 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 FGF13Q92913 245 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GTF3C6Q969F1 213 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 LENG9Q96B70 501 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SHDQ96IW2 340 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 MAP3K14Q99558 947 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 RNF39Q9H2S5 420 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CHRDQ9H2X0 955 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 CDH7Q9ULB5 785 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 KIF3AQ9Y496 699 aa6.59□□□□□ -1.35
CHRNA4-218ENST00000637243 MAST4O15021 2626 aa6.59□□□□□ -1.36
CHRNA4-218ENST00000637243 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA4-218ENST00000637243 K7ESF4 209 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA4-218ENST00000637243 GIPC1O14908 333 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA4-218ENST00000637243 MAGEB2O15479 319 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA4-218ENST00000637243 ADAM12O43184 909 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA4-218ENST00000637243 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CHRNA4-218ENST00000637243 ZMYND10O75800 440 aa6.58□□□□□ -1.36
CHRNA4-218ENST00000637243 LARGE1O95461 756 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms