RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636904.1

U6.97-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.97-201ENST00000636904 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 DNAJB8Q8NHS0 232 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NEUROG1Q92886 237 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 MIB2Q96AX9 1013 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 MYO19Q96H55 970 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 TMEM176AQ96HP8 235 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NGLY1Q96IV0 654 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 B3GALT6Q96L58 329 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZSWIM3Q96MP5 696 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 DUX5Q96PT3 197 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 EPYCQ99645 322 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 BEGAINQ9BUH8 593 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ASPNQ9BXN1 380 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 AP5M1Q9H0R1 490 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 GTSE1Q9NYZ3 720 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 DMTF1Q9Y222 760 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 BRWD3Q6RI45 1802 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 FAT1Q14517 4588 aa-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ABCA7Q8IZY2 2146 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SHISA3A0PJX4 238 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PRR32B1ATL7 298 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ACPPP15309 386 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PDE6AP16499 860 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PTGS1P23219 599 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 MLH1P40692 756 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 EPHA5P54756 1037 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 FAM189BP81408 668 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 FPGSQ05932 587 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 MAP2K5Q13163 448 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 TP53BP2Q13625 1128 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CNGA3Q16281 694 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PROSER3Q2NL68 480 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 RASIP1Q5U651 963 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 WWC2Q6AWC2 1192 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZPBP2Q6X784 338 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 TMEM135Q86UB9 458 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 RTN4RL2Q86UN3 420 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CNGA4Q8IV77 575 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NAXDQ8IW45 347 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 RGS22Q8NE09 1264 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CUL5Q93034 780 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 NKD1Q969G9 470 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PHF21BQ96EK2 531 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 Q96MF0 132 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SLC25A33Q9BSK2 321 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 TRIM55Q9BYV6 548 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CDT1Q9H211 546 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 RETNQ9HD89 108 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 RNF19AQ9NV58 838 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 KLK14Q9P0G3 267 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PADI4Q9UM07 663 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CDC14AQ9UNH5 594 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 COG5Q9UP83 839 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SERPINE3A8MV23 424 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 PODXLO00592 558 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 HGSO14964 777 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 RGL2O15211 777 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 FKTNO75072 461 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 DEDDO75618 318 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 TRPA1O75762 1119 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 FBXO21O94952 628 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SPDEFO95238 335 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 SPATA31D3P0C874 917 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ZNF853P0CG23 659 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 CGB7P0DN87 165 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 ATP6V1B1P15313 513 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 L1CAMP32004 1257 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 HUNKP57058 714 aa-0.9□□□□□ -2.55
U6.97-201ENST00000636904 HGFACQ04756 655 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms