RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 SYN1P17600 705 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC6A9P48067 706 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM193AP78312 1265 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 AGBL4Q5VU57 503 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 CARFQ8N187 725 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 C3orf20Q8ND61 904 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 OR7D4Q8NG98 312 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC39A13Q96H72 371 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 POLHQ9Y253 713 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 CAPN8A6NHC0 703 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 FFAR3O14843 346 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 TOX4O94842 621 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 C1QTNF9P0C862 333 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 SREBF1P36956 1147 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 HK3P52790 923 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 KRT40Q6A162 431 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 USP30Q70CQ3 517 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 TMX3Q96JJ7 454 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC38A3Q99624 504 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 LDAHQ9H6V9 325 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 LANCL2Q9NS86 450 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 L1RE1Q9UN81 338 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 C9orf118A6NHY6 69 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 ITGA10O75578 1167 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 GASTP01350 101 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 KRT1P04264 644 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 GYPEP15421 78 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 CRHR1P34998 444 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 CACNB3P54284 484 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 BPIFB4P59827 614 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 DUSP2Q05923 314 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 NOGQ13253 232 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB39AQ14964 217 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 RNF220Q5VTB9 566 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 MCTP1Q6DN14 999 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 MORC4Q8TE76 937 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 ARMT1Q9H993 441 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
SMARCA2-241ENST00000635397 ADCY6O43306 1168 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 MTSS1O43312 755 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 ARIH2O95376 493 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 MYL3P08590 195 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 PTPN7P35236 360 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 SEMA5AQ13591 1074 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 ACAP1Q15027 740 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 TBR1Q16650 682 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 REPS2Q8NFH8 660 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 SAMD11Q96NU1 681 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 CD320Q9NPF0 282 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM140Q9NV12 185 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A088AWK7 358 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 H3BUI4 141 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 GOLIM4O00461 696 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGAP6O43182 974 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR32O75388 356 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms