RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TRAF5O00463 557 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 RIPK2O43353 540 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CPA2P48052 419 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GIT2Q14161 759 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 LIN52Q52LA3 116 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 DUPD1Q68J44 220 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CDH23Q9H251 3354 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0J9YVX5 310 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 KLRF2D3W0D1 207 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC188H7C350 402 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PGM3O95394 542 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF24P17028 368 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 RASSF2P50749 326 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 LSAMPQ13449 338 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SATL1Q86VE3 508 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 AZIN2Q96A70 460 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 KRT82Q9NSB4 513 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TMCO1Q9UM00 188 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 WDR91A4D1P6 747 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SMCO2A6NFE2 343 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 O00370 1275 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MAP3K7O43318 606 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 VPS41P49754 854 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GPSM2P81274 684 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GJB7Q6PEY0 223 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CALML4Q96GE6 196 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TTC1Q99614 292 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 G3V3G9 751 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TMCC1O94876 653 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 OR52Z1P0C646 297 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 VAV1P15498 845 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TAC1P20366 129 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 MARK3P27448 753 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 OVGP1Q12889 678 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 PARP6Q2NL67 630 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM110Q86TL2 294 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 IWS1Q96ST2 819 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CEP72Q9P209 647 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP69A5D8W1 941 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 E7ENQ6 273 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 ASLP04424 464 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CETPP11597 493 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 AMPD1P23109 780 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 CA8P35219 290 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-211ENST00000618610 GRIA2P42262 883 aa8.74□□□□□ -1.01
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