RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	MARCH5	Q9NX47	278 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	IRAK3	Q9Y616	596 aa		21.26	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	C2CD2L	O14523	706 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	N4BP3	O15049	544 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	EPCAM	P16422	314 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	KIFAP3	Q92845	792 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	DNM3	Q9UQ16	869 aa		21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061		F8W810	466 aa		21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	NR1I2	O75469	434 aa		21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	EDN1	P05305	212 aa		21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	DSC1	Q08554	894 aa		21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	STK39	Q9UEW8	545 aa		21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	MYH11	P35749	1972 aa		21.24	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	ACKR2	O00590	384 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	SOD2	P04179	222 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	UROD	P06132	367 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	GRIK3	Q13003	919 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	CES5A	Q6NT32	575 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	SNTG2	Q9NY99	539 aa		21.23	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	CCDC169	A6NNP5	214 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PRR33	A8MZF0	331 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	WEE2	P0C1S8	567 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	KLRC2	P26717	231 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	EFNA5	P52803	228 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	KANK3	Q6NY19	840 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	KCNK18	Q7Z418	384 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	RABGGTA	Q92696	567 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	TRIP11	Q15643	1979 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PLXNA3	P51805	1871 aa		21.22	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	HIP1R	O75146	1068 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PEX3	P56589	373 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	ITIH3	Q06033	890 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	CABP7	Q86V35	215 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	PLIN2	Q99541	437 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		21.21	■□□□□ 0.99
ILF3-223	ENST00000593061	RECQL4	O94761	1208 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	GLUD2	P49448	558 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	DAW1	Q8N136	415 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	B3GALT6	Q96L58	329 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	POMK	Q9H5K3	350 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	GDA	Q9Y2T3	454 aa		21.2	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	TECTA	O75443	2155 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061		K7ERI5	159 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	LILRB3	O75022	631 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	NPTX2	P47972	431 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	FUT10	Q6P4F1	479 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	DRC1	Q96MC2	740 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	FBXL18	Q96ME1	805 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	PNMA5	Q96PV4	448 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		21.19	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	PTGES	O14684	152 aa		21.18	■□□□□ 0.98
ILF3-223	ENST00000593061	MTHFR	P42898	656 aa		21.18	■□□□□ 0.98

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