RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TOM1L1O75674 476 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 AFPP02771 609 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 KCNH2Q12809 1159 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TRIM14Q14142 442 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TCERG1LQ5VWI1 586 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GPD1LQ8N335 351 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 SAAL1Q96ER3 474 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 FBXL18Q96ME1 805 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ARID3AQ99856 593 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TCHPQ9BT92 498 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 NUP58Q9BVL2 599 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 MYH11P35749 1972 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF233A6NK53 670 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 CLDN3O15551 220 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 EXTL3O43909 919 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GPR32O75388 356 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TPM1P09493 284 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 VAMP7P51809 220 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ENPEPQ07075 957 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 BFSP1Q12934 665 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ITGA7Q13683 1181 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 SYCP1Q15431 976 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PTPN21Q16825 1174 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 KIZQ2M2Z5 673 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 USP37Q86T82 979 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 RSPH3Q86UC2 560 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 SLC35C1Q96A29 364 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 IQCDQ96DY2 449 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 USP20Q9Y2K6 914 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 KBTBD13C9JR72 458 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 STX10O60499 249 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ERLIN2O94905 339 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 EDN1P05305 212 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 MCL1Q07820 350 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 SERINC5Q86VE9 423 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.592e-9■■□□□ 14.5
TRPS1-210ENST00000519815 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GINS2Q9Y248 185 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GRIN2DO15399 1336 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 M0QZ92 97 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 OGTO15294 1046 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 B4GALT5O43286 388 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 ADRB2P07550 413 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 IQCF3P0C7M6 154 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 CCL5P13501 91 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 PROZP22891 400 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 FMO5P49326 533 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-210ENST00000519815 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
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