RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 MPIG6BO95866 241 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 HMGA2P52926 109 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 CD83Q01151 205 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 RNF151Q2KHN1 245 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 HS1BP3Q53T59 392 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 ZNF790Q6PG37 636 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 Q8TCH9 128 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 ANXA1P04083 346 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 OR14A2Q96R54 314 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-211ENST00000484135 BCL9O00512 1426 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 SBF2Q86WG5 1849 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 MRC1P22897 1456 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 ASLP04424 464 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MRE11P49959 708 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 KIF11P52732 1056 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K12Q12852 859 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 SQSTM1Q13501 440 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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