RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 NR2E1Q9Y466 385 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PLXNA3P51805 1871 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 CARNS1A5YM72 827 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM221A6NGB7 291 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 E9PMD0 336 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 M0R296 226 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TADA2AO75478 443 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PRKCBP05771 671 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.988e-6■■■□□ 17.3
CTPS1-209ENST00000480420 RPA1P27694 616 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 CDC25AP30304 524 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 MTHFRP42898 656 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 OSTNP61366 133 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 GIT2Q14161 759 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 RABEP1Q15276 862 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PTPN14Q15678 1187 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 MAPK6Q16659 721 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 KRT79Q5XKE5 535 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PALB2Q86YC2 1186 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 BSNDQ8WZ55 320 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 EDAQ92838 391 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC51Q96ER9 411 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 KIF2CQ99661 725 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 S1PR5Q9H228 398 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 POMKQ9H5K3 350 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PIDD1Q9HB75 910 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 SNTG2Q9NY99 539 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 N4BP3O15049 544 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ASGR2P07307 311 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 CYP11B2P19099 503 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 GJB2P29033 226 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TRAPPC10P48553 1259 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 GLUD2P49448 558 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ZXDAP98168 799 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ITIH3Q06033 890 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2R5AQ15172 486 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ECM1Q16610 540 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 SUSD6Q92537 303 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 FBXL18Q96ME1 805 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TCHPQ9BT92 498 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 DNM3Q9UQ16 869 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.91□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GUA9 196 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 SFI1A8K8P3 1242 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 K7ERI5 159 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 RECQL4O94761 1208 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 SOD2P04179 222 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ADH1AP07327 375 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PEX3P56589 373 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 GRIK3Q13003 919 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 AMHR2Q16671 573 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.9□□□□□ -0.98
CTPS1-209ENST00000480420 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.9□□□□□ -0.98
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