RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZFP42Q96MM3 310 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZHX3Q9H4I2 956 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STK39Q9UEW8 545 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP20Q9Y2K6 914 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YEATS4O95619 227 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC11A1P49279 550 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNQ1P51787 676 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERVFC1P60507 584 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARSHQ5FYA8 562 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP49Q70CQ1 688 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYCT1Q8N699 235 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGSF21Q96ID5 467 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 REEP2Q9BRK0 252 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCHPQ9BT92 498 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PARVGQ9HBI0 331 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KLK14Q9P0G3 267 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INPPL1O15357 1258 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP6R2O75170 966 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDHD2O94830 711 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR1G1P47890 313 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NDUFV1P49821 464 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNTG2Q9NY99 539 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CFAP45Q9UL16 551 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM50BQ9Y247 325 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FSCN2O14926 492 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCP2P22307 547 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STAT6P42226 847 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRIK3Q13003 919 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATL3Q6DD88 541 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SV2BQ7L1I2 683 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VPS52Q8N1B4 723 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BICD1Q96G01 975 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GDAQ9Y2T3 454 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRWD1Q9NSI6 2320 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RECQL4O94761 1208 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EDN1P05305 212 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL19A1Q14993 1142 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EFHBQ8N7U6 833 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC15Q8TF66 581 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 K7ENM7 598 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NRP1O14786 923 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PER2O15055 1255 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BMP1P13497 986 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCD1P33897 745 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PKP1Q13835 747 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GIT2Q14161 759 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZBTB33Q86T24 672 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PANK2Q9BZ23 570 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRAK2O60296 914 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B4GALT3O60512 393 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CUTAO60888 179 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TOM1L1O75674 476 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CXCL14O95715 111 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms