RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435088.1

RPS15AP28-201, Transcript of ribosomal protein S15a pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPS15AP28, Length 386 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS15AP28-201ENST00000435088 TRDNQ13061 729 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 LAPTM5Q13571 262 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 KRT32Q14532 448 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TNIP1Q15025 636 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 DLGAP5Q15398 846 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ALX1Q15699 326 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ME3Q16798 604 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 AKNAD1Q5T1N1 836 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 DLK2Q6UY11 383 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 LBX2Q6XYB7 198 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 MFSD6Q6ZSS7 791 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 RIOX2Q8IUF8 465 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 CCDC83Q8IWF9 413 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 NCOA7Q8NI08 942 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 STAG1Q8WVM7 1258 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 FAM168AQ92567 244 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PTPRN2Q92932 1015 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 SNX21Q969T3 373 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TMX3Q96JJ7 454 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TTC14Q96N46 770 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PHF20Q9BVI0 1012 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 GULP1Q9UBP9 304 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 HDAC9Q9UKV0 1011 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TPCN1Q9ULQ1 816 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TRAF6Q9Y4K3 522 aa2.74□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 LRRC37AA6NMS7 1700 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 LTBP1Q14766 1721 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TNKSO95271 1327 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 CCDC69A6NI79 296 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TSPY2A6NKD2 308 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 GOLGA8BA8MQT2 603 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 H7BY64 318 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 WNT10BO00744 389 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 NPHS1O60500 1241 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 HLA-DOAP06340 250 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 FPR2P25090 351 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 GJB2P29033 226 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 MCM5P33992 734 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 BCL6P41182 706 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 EPS15P42566 896 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 KCNJ6P48051 423 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 GPR85P60893 370 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 RBM10P98175 930 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 CYP4F8P98187 520 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TFAP4Q01664 338 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ST3GAL1Q11201 340 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PKP1Q13835 747 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PRKG1Q13976 671 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 KCNMB1Q16558 191 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 SBK1Q52WX2 424 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 EMC4Q5J8M3 183 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 C12orf60Q5U649 245 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 HHIPL2Q6UWX4 724 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 RPTNQ6XPR3 784 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 USP53Q70EK8 1073 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 MIGA2Q7L4E1 593 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 RASGRP2Q7LDG7 609 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 MICU3Q86XE3 530 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TICAM2Q86XR7 235 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 AMOTL1Q8IY63 956 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 SYNPOQ8N3V7 929 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 LZTR1Q8N653 840 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 NUP43Q8NFH3 380 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 NUP133Q8WUM0 1156 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 PIBF1Q8WXW3 757 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 ESR2Q92731 530 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 IL17RAQ96F46 866 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 DDX11Q96FC9 970 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 UBAC1Q9BSL1 405 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TM6SF1Q9BZW5 370 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.73□□□□□ -1.97
RPS15AP28-201ENST00000435088 SLC6A17Q9H1V8 727 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms