RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 RTKNQ9BST9 563 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 EPC1Q9H2F5 836 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 USP18Q9UMW8 372 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 HES2Q9Y543 173 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 TDP2O95551 362 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 RCAN1P53805 252 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 LMNB2Q03252 620 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 USP41Q3LFD5 358 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 Q4G0T1 1027 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 RABGGTAQ92696 567 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 ACACBO00763 2458 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 SPTBN2O15020 2390 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 PSMC5P62195 406 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 RNF20Q5VTR2 975 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 RASEFQ8IZ41 740 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 TBCKQ8TEA7 893 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 FGF13Q92913 245 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 NR1I2O75469 434 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 ADRB1P08588 477 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 MTSS1LQ765P7 747 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 GPR65Q8IYL9 337 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 ITFG1Q8TB96 612 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CPB2Q96IY4 423 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 APOL6Q9BWW8 343 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 EML1O00423 815 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEA9P43362 315 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 SLC7A3Q8WY07 619 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN23Q96B33 292 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 KXD1Q9BQD3 176 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D4O60343 1298 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN1O60635 241 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CPA1P15085 419 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 RTP2Q5QGT7 225 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 RNF149Q8NC42 400 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CEP170P1Q96L14 293 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD12-201ENST00000404162 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 CCL16O15467 120 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 ERLIN2O94905 339 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 CYP3A7P24462 503 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 PFKPQ01813 784 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 FZD5Q13467 585 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 TPRG1Q6ZUI0 275 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 CSRNP2Q9H175 543 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 POLIQ9UNA4 740 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 TADA2AO75478 443 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 C8AP07357 584 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP5P24588 427 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 CREMQ03060 361 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 NTRK3Q16288 839 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 NOTUMQ6P988 496 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 FERMT3Q86UX7 667 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 NOTCH4Q99466 2003 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 SHISA7A6NL88 538 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 ASAP2O43150 1006 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 AXLP30530 894 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 RFC5P40937 340 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 NLRP5P59047 1200 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 FGD1P98174 961 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 SPEM2Q0P670 501 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 LPAL2Q16609 132 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 LIN9Q5TKA1 542 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 Q6ZUG5 572 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD12-201ENST00000404162 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms