RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264839.11

RIMS1-201, Transcript of regulating synaptic membrane exocytosis 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RIMS1, Length 7,055 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1-201ENST00000264839 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 GJB7Q6PEY0 223 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RAD9BQ6WBX8 426 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 BTN2A2Q8WVV5 523 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NDFIP2Q9NV92 336 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 BABAM1Q9NWV8 329 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ATP10BO94823 1461 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 GRAP2O75791 330 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NME5P56597 212 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ABI1Q8IZP0 508 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 GANCQ8TET4 914 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SLC9A2Q9UBY0 812 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ITM2BQ9Y287 266 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KPNA7A9QM74 516 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 APBA3O96018 575 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KCNA2P16389 499 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SMTNL2Q2TAL5 461 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KLHL38Q2WGJ6 581 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF699Q32M78 642 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CNKSR1Q969H4 720 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PGBD4Q96DM1 585 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 AS3MTQ9HBK9 375 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NOD2Q9HC29 1040 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KRT8P05787 483 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KRT4P19013 534 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 IRAK1P51617 712 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CCDC142Q17RM4 750 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 BBS5Q8N3I7 341 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ANKRD7Q92527 254 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ULK4Q96C45 1275 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NEUROG2Q9H2A3 272 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CCT7Q99832 543 aa13.37□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 EMSYQ7Z589 1322 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 B2RBV5 119 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 MAPK10P53779 464 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 EPC2Q52LR7 807 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SPDYAQ5MJ70 313 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ARHGAP18Q8N392 663 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PDLIM2Q96JY6 352 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 BRD8Q9H0E9 1235 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PIF1Q9H611 641 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 LY9Q9HBG7 655 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SNX12Q9UMY4 172 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 H0YCG3 227 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 MAP3K6O95382 1288 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 APRTP07741 180 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 HDAC4P56524 1084 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TAS2R42Q7RTR8 314 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 MIER2Q8N344 545 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DNAJC3Q13217 504 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TTC8Q8TAM2 541 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PAMP19021 973 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 A0A0G2JLW4 131 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NMT1P30419 496 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 RCN1Q15293 331 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 VPS50Q96JG6 964 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM120BA0PK00 339 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 NFIBO00712 420 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 YY1P25490 414 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ATP6V1E1P36543 226 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.36□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ALDH1B1P30837 517 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CDH6P55285 790 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 LZICQ8WZA0 190 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM117Q9H0C3 514 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DENND3A2RUS2 1198 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 FOSP01100 380 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ANGPT1Q15389 498 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 DLGAP3O95886 979 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 AVPR1AP37288 418 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 PLA2G4AP47712 749 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 KIZQ2M2Z5 673 aa13.35□□□□□ -0.27
RIMS1-201ENST00000264839 SGO1Q5FBB7 561 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms