RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 CARD6Q9BX69 1037 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GPR25O00155 361 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CYP26A1O43174 497 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 STRNO43815 780 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 EVI5O60447 810 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KIF20AO95235 890 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GJB6O95452 261 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MMP3P08254 477 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGAP25P42331 645 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NCKAP1LP55160 1127 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CDH8P55286 799 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MYL7Q01449 175 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 AMHR2Q16671 573 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 DMAC2Q9NW81 257 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 WEE2P0C1S8 567 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FKBP1BP68106 108 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 DUSP28Q4G0W2 176 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GBP6Q6ZN66 633 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SESTD1Q86VW0 696 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KAT2BQ92831 832 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KIFAP3Q92845 792 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CEP63Q96MT8 703 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GANQ9H2C0 597 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 HCRTO43612 131 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MSCO60682 206 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FTCDO95954 541 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 COPB2P35606 906 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ARL2P36404 184 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GRIK4Q16099 956 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PANX2Q96RD6 677 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PQC6 194 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ADCY3O60266 1144 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZMYND10O75800 440 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PRKCBP05771 671 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KRT5P13647 590 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MAGEA1P43355 309 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC142Q17RM4 750 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PDXDC1Q6P996 788 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FNBP1Q96RU3 617 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RNF39Q9H2S5 420 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TET1Q8NFU7 2136 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 C22orf31O95567 290 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MAPK4P31152 587 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RAP1GAPP47736 663 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 VEGFBP49765 207 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 BTBD6Q96KE9 485 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJC7Q99615 494 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TOMM70O94826 608 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SGPL1O95470 568 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MAPK6Q16659 721 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PNMA2Q9UL42 364 aa7.13□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TTC3P53804 2025 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms