RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)L

tS(GCU)L, Transcript of Asparagine tRNA (tRNA-Asn), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tS(GCU)L, Length 80 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)LtS(GCU)L IES6P32617 166 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L SUR1P33300 382 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L VBA2P38358 474 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L SWD1P39706 426 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L OST1P41543 476 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L TAX4P47030 604 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L NOP9P47077 666 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L TYW3P53177 273 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L RSM23Q01163 450 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L PEX12Q04370 399 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L HFD1Q04458 532 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L SRL1Q08673 210 aa7.42□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L RRP7P25368 297 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L YBR241CP38142 488 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L CHA4P43634 648 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L YDL186WP48568 277 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L MIG2P53035 382 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L GPI1P53306 609 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L DSL1P53847 754 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L SUB1P54000 292 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L ARG5,6Q01217 863 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L DIG2Q03373 323 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L MSS11Q03825 758 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L SPC19Q03954 165 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L IRC25Q07951 179 aa7.41□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L RMD9P53140 646 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L GET1P53192 235 aa7.4□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L COX18P53239 316 aa7.4□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L NUP49Q02199 472 aa7.4□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L AIM36Q03798 255 aa7.4□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L DLT1Q04216 342 aa7.4□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L NFI1Q12216 726 aa7.4□□□□□ -1.22
tS(GCU)LtS(GCU)L COX5BP00425 151 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L KRR1P25586 316 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L TCA17P32613 152 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L PEX6P33760 1030 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L YOX1P34161 385 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L SRP102P36057 244 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L SKG1P36169 355 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L FIG1P38224 298 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L TRM5P38793 499 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L UFD1P53044 361 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L NNT1Q05874 261 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa7.39□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L ILV5P06168 395 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L PCL1P24867 279 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L CLB4P24871 460 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L BUD5P25300 642 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L ACH1P32316 526 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L BAP2P38084 609 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L TAT1P38085 619 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L PSD1P39006 500 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L RBG1P39729 369 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L SAM37P50110 327 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L RRN9P53437 365 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L SPR6Q01684 191 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L GPI17Q04080 534 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L GTB1Q04924 702 aa7.38□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L TDH2P00358 332 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data7.37□□□□□ -1.23not detected
tS(GCU)LtS(GCU)L SNF6P18888 332 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L ELO2P25358 347 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L PRP19P32523 503 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L MCH2P36032 473 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data7.37□□□□□ -1.23not detected
tS(GCU)LtS(GCU)L TCM62P38228 572 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L CTF8P38877 133 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L AGE2P40529 298 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L YNL095CP53932 642 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L ABZ2Q03266 374 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L MRX10Q05648 414 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L YPR098CQ06089 161 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L ATG26Q06321 1198 aa7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L MRPS28P21771 286 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L CPR2P23285 205 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L RPC82P32349 654 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L SIC1P38634 284 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L BNA1P47096 177 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L EXG2P52911 562 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L NSA1P53136 463 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L HHT1P61830 136 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L BRE4Q07660 1125 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L YDL009CQ12210 107 aa7.36□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L NAM2P11325 894 aa7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L SUA7P29055 345 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L DEG1P31115 442 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L NTG1P31378 399 aa7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L ARC40P38328 384 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L SLM1P40485 686 aa7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L CIN2P46670 268 aa7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L MTL1P53214 551 aa7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L TY1A-BLQ12266 440 aa7.35□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L STE18P18852 110 aa7.34□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L MEK1P24719 497 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
tS(GCU)LtS(GCU)L SSE2P32590 693 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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