RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C YPR097WQ06839 1073 aa5.93□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C YDL114WQ07530 308 aa5.93□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C ACF2Q12168 779 aa5.93□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C RRI1Q12468 440 aa5.93□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C DBF2P22204 572 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C PTP2P29461 750 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C VMA11P32842 164 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C YKL102CP34249 101 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C SPC34P36131 295 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C FAT1P38225 669 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C RTC2P38279 296 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C SAM37P50110 327 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C GTR1Q00582 310 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C NUP49Q02199 472 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C AIM36Q03798 255 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C CSI2Q08054 341 aa5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C DSF1P0CX08 502 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C YNR073CP0CX09 502 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C DPH5P32469 300 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C MRPL6P32904 214 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C PDX3P38075 228 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C RPS20P38701 121 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C CHL4P38907 458 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C FLX1P40464 311 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C LOH1P47055 219 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C HMS2P47175 358 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C RMR1P53060 241 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C RIM9Q04734 239 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C ELP6Q04868 273 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C MLC2Q06580 163 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa5.91□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C BOS1P25385 244 aa5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C CDC3P32457 520 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C SUR1P33300 382 aa5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C HIS6P40545 261 aa5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.9□□□□□ -1.46not detected
SPE3YPR069C AGP3P43548 558 aa5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C YHC3P47040 408 aa5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C SMM1P53720 384 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C RSM23Q01163 450 aa5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C NNT1Q05874 261 aa5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C YLR126CQ12288 251 aa5.9□□□□□ -1.46
SPE3YPR069C COX5BP00425 151 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PDE2P06776 526 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PHO80P20052 293 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C CPR2P23285 205 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PCL1P24867 279 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C TAT1P38085 619 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C OST1P41543 476 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C DIM1P41819 318 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C GZF3P42944 551 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C QRI7P43122 407 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C FAR7P43592 221 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RMD9P53140 646 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YDC1Q02896 317 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C DIG2Q03373 323 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YDR239CQ03780 787 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C SSK1Q07084 712 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C VIK1Q12045 647 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C TY1A-BLQ12266 440 aa5.89□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RPS13P05756 151 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YCL002CP25565 263 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C SBE22P38814 852 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C ARO9P38840 513 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PPT1P53043 513 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C GEP7P53171 287 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C TYW3P53177 273 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YNR064CP53750 290 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C OST6Q03723 332 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YMR317WQ04893 1140 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RIB3Q99258 208 aa5.88□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RPL39P04650 51 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C STE18P18852 110 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C GPI18P38211 433 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C CTR2P38865 189 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PHO90P39535 881 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YAR028WP39548 234 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PUG1P40100 303 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C SFH5P47008 294 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C COS10P52924 374 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PGA1P53896 198 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C HHT1P61830 136 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C MSS11Q03825 758 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C DLT1Q04216 342 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C BRE4Q07660 1125 aa5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data5.86□□□□□ -1.47not detected
SPE3YPR069C NAM2P11325 894 aa5.86□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YHR035WP38769 630 aa5.86□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RRG9P40156 214 aa5.86□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YLR108CQ12259 485 aa5.86□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YGR161W-CQ3E744 92 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.8 ms