RNA–Protein interactions for RNA: YOR104W

PIN2, Transcript of Exomer-dependent cargo protein, yeast

Gene PIN2, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIN2	YOR104W	MCM10	P32354	571 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	GPI16	P38875	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MDM31	P38880	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MLH1	P38920	769 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	STB1	P42845	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SSY5	P47002	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	UBX6	P47049	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YGR126W	P53274	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	TLG1	Q03322	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	ELP6	Q04868	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	FMP45	Q07651	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	GRE1	Q08969	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SIA1	Q12212	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	PCL9	Q12477	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MED11	Q99278	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	VCX1	Q99385	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SPO7	P18410	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SUR1	P33300	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	ECM4	P36156	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YHR035W	P38769	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	IPT1	P38954	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	KRE29	P40026	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	BUR6	P40096	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	XBP1	P40489	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	IRC7	P43623	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	BUD17	P53727	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	OST6	Q03723	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	FIN1	Q03898	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	GAS2	Q06135	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	ATG17	Q06410	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	TRM10	Q12400	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MSW1	P04803	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SEC12	P11655	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RPB8	P20436	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MDH2	P22133	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	PTC6	P25646	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
PIN2	YOR104W	YME2	P32843	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	AFR1	P33304	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RTC2	P38279	296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RPP1	P38786	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	PHO90	P39535	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YIL169C	P40442	995 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	HIS6	P40545	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	SFH5	P47008	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	RRN9	P53437	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	ARP10	Q04549	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	HRT1	Q08273	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	BAG7	Q12128	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	FLO9	P39712	1322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PIN2	YOR104W	MET2	P08465	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	CTA1	P15202	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
PIN2	YOR104W	MRPL39	P36533	70 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	MSY1	P48527	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	BRR6	P53062	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	MRPL19	P53875	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	PGA1	P53896	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	RNH1	Q04740	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	ACF2	Q12168	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	MET17	P06106	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	PRB1	P09232	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	CNA1	P23287	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	STE50	P25344	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	RPD3	P32561	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIN2	YOR104W	COS9	P36034	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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