RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W VMA11P32842 164 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SPO23P33757 523 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W VPS21P36017 210 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SPC34P36131 295 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W FAA2P39518 744 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W COA1P40452 197 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W DIM1P41819 318 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ABM1P47146 123 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YGR126WP53274 230 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SMM1P53720 384 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SED1Q01589 338 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PRM15Q03262 622 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YMR155WQ03795 547 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RIM9Q04734 239 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W FDH1Q08911 376 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YDL180WQ12301 547 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RHO1P06780 209 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W CBS2P14905 389 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W HEM15P16622 393 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SEN2P16658 377 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W EHD3P28817 500 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W PAP1P29468 568 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W LAG1P38703 411 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W CCT2P39076 527 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W JEM1P40358 645 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W POP1P41812 875 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W MOB2P43563 287 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W AIM22P47051 409 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W AIF1P52923 378 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SWP1Q02795 286 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YPL039WQ03080 316 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YMR209CQ03648 457 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W KRE28Q04431 385 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YET3Q07451 203 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RLM1Q12224 676 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W ATG34Q12292 412 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YPR096CO13587 100 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data1.83□□□□□ -2.12not detected
SSQ1YLR369W COX13P32799 129 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SSO1P32867 290 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W TRS65P32893 560 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RPT5P33297 434 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YOX1P34161 385 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W PHD1P36093 366 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W ETR1P38071 380 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SDS24P38314 527 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YHR218WP38899 603 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W CAJ1P39101 391 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RFC4P40339 323 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W AGE2P40529 298 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W AXL1P40851 1208 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YJR154WP47181 346 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W MRPL19P53875 158 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W VPS71Q03433 280 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YML108WQ03759 105 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YDR239CQ03780 787 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YMR027WQ04371 470 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SSK1Q07084 712 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SRL2Q12020 392 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W PPT2Q12036 173 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W GET4Q12125 312 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RGS2Q99188 309 aa1.83□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W MSI1P13712 422 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W KSS1P14681 368 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RPS5P26783 225 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SNC1P31109 117 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W ACP1P32463 125 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W MNS1P32906 549 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YCR087C-AP37263 153 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W STP2P38704 541 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YHB1P39676 399 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W YER084WP40057 128 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W FMP32P43557 207 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W ADO1P47143 340 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W ILM1P47155 203 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W RPS12P48589 143 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SIP18P50263 79 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W APJ1P53940 528 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W REX2P54964 269 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W SNZ1Q03148 297 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W MSS11Q03825 758 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W URH1Q04179 340 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W COX20Q04935 205 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W GMC2Q06201 188 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W GAT3Q07928 141 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W CSI2Q08054 341 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W HNT3Q08702 217 aa1.82□□□□□ -2.12
SSQ1YLR369W MET17P06106 444 aa1.81□□□□□ -2.12
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