RNA–Protein interactions for RNA: YKL008C

LAC1, Transcript of Ceramide synthase component, yeast

Gene LAC1, Length 1,257 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAC1	YKL008C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	FMT1	P32785	401 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	FRM2	P37261	193 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	FRT2	P39734	528 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	RRG9	P40156	214 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YPR1	Q12458	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	ZRT1	P32804	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	PRY2	P36110	329 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	TRR2	P38816	342 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	CTM1	P38818	585 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	PRM7	Q12459	698 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YKL187C	P34231	750 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YMR262W	P38430	313 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	PES4	P39684	611 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	OKP1	P53298	406 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	UBX2	Q04228	584 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	APC4	Q04601	652 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	ECM19	Q06011	112 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	CUR1	Q06469	252 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	MDY2	Q12285	212 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	CKA2	P19454	339 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	RPB9	P27999	122 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	SNX41	Q04053	625 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	FIG2	P25653	1609 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	LYS2	P07702	1392 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	RIM15	P43565	1770 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YHR035W	P38769	630 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YIR035C	P40579	254 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YGR266W	P53326	701 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YNR066C	P53752	436 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YPR195C	Q06594	109 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	CPT1	P17898	393 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	INO2	P26798	304 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	SLM1	P40485	686 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YIL054W	P40524	105 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	YGL118C	P53132	145 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	CAX4	P53223	239 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
LAC1	YKL008C	MIC19	P43594	170 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	ASG7	P46993	209 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	ZRG17	P53735	605 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	GMC1	Q04399	608 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	TFC7	Q12415	435 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	AST1	P35183	429 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	VOA1	P53262	265 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	VAC14	Q06708	880 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	YOR292C	Q08743	309 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	TRM10	Q12400	293 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	SIR4	P11978	1358 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	RAD7	P06779	565 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	AGA2	P32781	87 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	YBR062C	P38239	180 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	YPC1	P38298	316 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	GSC2	P40989	1895 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	RRG8	Q06109	277 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected
LAC1	YKL008C	CUP2	P15315	225 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	GPX1	P36014	167 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	MCH2	P36032	473 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	YIL059C	P40520	121 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	BIO4	P53630	237 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	VIK1	Q12045	647 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	APC9	Q12107	265 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	LAG2	Q92325	660 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	IZH4	Q99393	312 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	COS4	P43542	379 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	LOH1	P47055	219 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	CPR7	P47103	393 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LAC1	YKL008C	SWC4	P53201	476 aa		3.04	□□□□□ -1.92

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