RNA–Protein interactions for RNA: YJL024C

APS3, Transcript of Small subunit of the clathrin-associated adaptor complex AP-3, yeast

Gene APS3, Length 585 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APS3	YJL024C	HMS1	Q12398	434 aa		5.09	□□□□□ -1.59
APS3	YJL024C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		5.09	□□□□□ -1.59
APS3	YJL024C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		5.09	□□□□□ -1.59
APS3	YJL024C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		5.09	□□□□□ -1.59
APS3	YJL024C	FLO9	P39712	1322 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	QCR7	P00128	127 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	OPI3	P05375	206 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	COX9	P07255	59 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	CPR2	P23285	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	STE50	P25344	346 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	BOS1	P25385	244 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YCR102C	P25608	368 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SPT14	P32363	452 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	DOA4	P32571	926 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PDR3	P33200	976 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YBR063C	P38083	404 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MBA1	P38300	278 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	POP1	P41812	875 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ECO1	P43605	281 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YJL055W	P47044	245 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	LYS5	P50113	272 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YKR005C	Q02203	525 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RSM24	Q03976	319 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MIX14	Q04341	121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RTN2	Q12443	393 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YPR1	Q12458	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ERG8	P24521	451 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	NFS1	P25374	497 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	THI4	P32318	326 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	VPS17	P32913	551 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	COS9	P36034	407 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	CCZ1	P38273	704 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YBR137W	P38276	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PEX32	P38292	413 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YER184C	P39961	794 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MIT1	P40002	666 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	REE1	P40893	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SER2	P42941	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MSY1	P48527	492 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PMT5	P52867	743 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YNL165W	P53891	406 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YPL039W	Q03080	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SDC1	Q03323	175 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PLB2	Q03674	706 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SSY1	Q03770	852 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	BNA7	Q04066	261 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	DAL4	Q04895	635 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SPR28	Q04921	423 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	GPN3	Q06543	272 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YOR378W	Q08902	515 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YPL278C	Q08990	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ATG41	Q12048	136 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YRM1	Q12340	786 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SFG1	Q12507	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MTR10	Q99189	972 aa		5.07	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YAL064W-B	O13512	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	CDC9	P04819	755 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SEC62	P21825	274 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MDH2	P22133	377 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ERG4	P25340	473 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ATS1	P31386	333 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PAU2	P32612	120 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SEC66	P33754	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MTH1	P35198	433 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	SHO1	P40073	367 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PRY1	P47032	299 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YJR120W	P47157	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	DOC1	P53068	250 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	YGR066C	P53242	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ERV29	P53337	310 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	HOL1	P53389	586 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	ASI3	P53983	676 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	PET191	Q02772	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	RSM28	Q03430	361 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	TDA1	Q03533	586 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MRX8	Q05473	314 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	MIM1	Q08176	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
APS3	YJL024C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6

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