RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	TPO5	P36029	618 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	HIS2	P38635	335 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	KEL2	P50090	882 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	ASR1	Q06834	288 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YOR292C	Q08743	309 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	TRM10	Q12400	293 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	ERP3	Q12403	225 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	CDC25	P04821	1589 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	FRM2	P37261	193 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	BDH1	P39714	382 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	VIK1	Q12045	647 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	POM33	Q12164	279 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	DNF1	P32660	1571 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	SMC4	Q12267	1418 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YCR025C	P25352	136 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YKL063C	P35725	167 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	FRT2	P39734	528 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	VAB2	P40003	282 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	TFC7	Q12415	435 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	MYO4	P32492	1471 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YBT1	P32386	1661 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	NTE1	Q04958	1679 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YIA6	P40556	373 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	PEX30	Q06169	523 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	IFM1	P25038	676 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	MIC19	P43594	170 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YGL118C	P53132	145 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	RPN14	P53196	417 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SPP2	Q02521	185 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	MRX8	Q05473	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	TRM732	Q03496	1420 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	VTH1	P40438	1549 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	VTH2	P40890	1549 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	TFS1	P14306	219 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	LSB1	P53281	241 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	DPP1	Q05521	289 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	GPN3	Q06543	272 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	IES4	Q08561	116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YSR3	P23501	404 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	ZIP1	P31111	875 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	TRR2	P38816	342 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SCC4	P40090	624 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YIL012W	P40551	113 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	TPN1	P53099	579 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	CAX4	P53223	239 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	CSI1	Q04368	295 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YPL278C	Q08990	100 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SPP41	P38904	1435 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	PAN1	P32521	1480 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	CKA2	P19454	339 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	VPH2	P32341	215 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	AEP1	P32493	518 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	MRPL37	P36532	105 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	MBA1	P38300	278 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	TDA11	P38854	504 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	RCY1	P39531	840 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	YIL054W	P40524	105 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	HST4	P53688	370 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	VBA1	Q04301	562 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	STH1	P32597	1359 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	NUP170	P38181	1502 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	CPT1	P17898	393 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	CDC42	P19073	191 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	ATG15	P25641	520 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SUA5	P32579	426 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	MRPL6	P32904	214 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	AIM29	P36154	155 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPC17	YJL011C	SLX1	P38324	304 aa		3.16	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18 ms