RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	YPK3	P38070	525 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YMR262W	P38430	313 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MTC6	P38849	526 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PCL6	P40038	420 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	SLZ1	P40167	298 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	SCW11	P53189	542 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MRPL19	P53875	158 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	ASI3	P53983	676 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PET191	Q02772	108 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	GAL83	Q04739	417 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MRX8	Q05473	314 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MDM36	Q06820	579 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RAF1	Q06891	181 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MCH4	Q08268	501 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	FRE6	Q12473	712 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PRB1	P09232	635 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	AHC2	P25649	128 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PAU24	P38155	120 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	FMP23	P38231	175 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PCP1	P53259	346 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	AIM36	Q03798	255 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MGR3	Q04472	501 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	FMP42	Q04991	504 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MCM21	Q06675	368 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MAK32	P23060	363 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	SED4	P25365	1065 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	VPS17	P32913	551 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PMT6	P42934	759 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PAM16	P42949	149 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	CCC1	P47818	322 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	ALG12	P53730	551 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YAP6	Q03935	383 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YMR252C	Q04814	134 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	HEM4	P06174	275 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	DBF2	P22204	572 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RSM22	P36056	628 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	PEX32	P38292	413 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	JLP2	P40206	208 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	IDP2	P41939	412 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SRL4	Q03085	281 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SSY1	Q03770	852 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YDR514C	Q04408	483 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	HLR1	Q04429	423 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	CRR1	Q05790	422 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	IES3	Q12345	250 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RRI1	Q12468	440 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	REP1	P03871	373 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SCEI	P03882	235 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SIR2	P06700	562 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	COX9	P07255	59 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MCM1	P11746	286 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	ITR1	P30605	584 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	DOA4	P32571	926 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	PPG1	P32838	368 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SPT10	P35208	640 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	GPX2	P38143	162 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	TIR3	P40552	269 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	GDS1	P41913	522 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MKC7	P53379	596 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YNL165W	P53891	406 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RCF1	Q03713	159 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	YDR387C	Q04162	555 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	RTN2	Q12443	393 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.63	□□□□□ -1.19	not detected
SPS100	YHR139C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	TRA1	P38811	3744 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MEC1	P38111	2368 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	PCL1	P24867	279 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	MTH1	P35198	433 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SLS1	P42900	643 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	PMT5	P52867	743 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	SCY1	P53009	804 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	IMO32	P53219	342 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SPS100	YHR139C	GPN3	Q06543	272 aa		7.62	□□□□□ -1.19

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