RNA–Protein interactions for RNA: YHL015W

RPS20, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS20, Length 366 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS20	YHL015W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.83	□□□□□ -2.28	not detected
RPS20	YHL015W	YBR062C	P38239	180 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	VAB2	P40003	282 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	RPE1	P46969	238 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	OST3	P48439	350 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	MND1	P53102	219 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	OKP1	P53298	406 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	MRS2	Q01926	470 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	ATG5	Q12380	294 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	EMC6	Q12431	108 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	AGC1	Q12482	902 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	RAD7	P06779	565 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	GAL3	P13045	520 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	END3	P39013	349 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	UBC13	P52490	153 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	TPN1	P53099	579 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	SLM2	P53955	656 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	DCR2	Q05924	578 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	CTS2	Q06350	511 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	PAN1	P32521	1480 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	SWI3	P32591	825 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YPC1	P38298	316 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	PHO89	P38361	574 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.81	□□□□□ -2.28	not detected
RPS20	YHL015W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	SPT8	P38915	602 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	COG3	P40094	801 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	COS6	P53344	381 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	PSY3	Q12318	242 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YPR064W	Q12492	139 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	TFS1	P14306	219 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	ERG2	P32352	222 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	AEP1	P32493	518 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YKL162C	P36052	402 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	FET3	P38993	636 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	SEN34	P39707	275 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YJL016W	P47072	561 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	COG7	P53195	279 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	CAB5	Q03941	241 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YLR297W	Q05899	129 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	RAD10	P06838	210 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	KRE6	P32486	720 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	COT1	P32798	439 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	BLI1	P35727	113 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YOR062C	P36025	268 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	POP8	P38208	133 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YHL026C	P38740	315 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YHI9	P38765	294 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	APE4	P38821	490 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	FCY21	P40039	528 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	AIM20	P40451	204 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	AVT7	P40501	490 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YIA6	P40556	373 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YOR268C	Q08734	132 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	APC9	Q12107	265 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	POM33	Q12164	279 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	SWC5	P38326	303 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	TDA11	P38854	504 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	GDS1	P41913	522 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YMR209C	Q03648	457 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YML018C	Q03730	393 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YOL019W	Q08157	551 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	BOL1	Q3E793	110 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	SUA5	P32579	426 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	YJL118W	P47022	219 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	COX16	P47081	118 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	YPL039W	Q03080	316 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	ECM18	Q04623	453 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	DPP1	Q05521	289 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	STE23	Q06010	1027 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	TAZ1	Q06510	381 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	ASR1	Q06834	288 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	RAD3	P06839	778 aa		0.76	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	YCR102C	P25608	368 aa		0.76	□□□□□ -2.29
RPS20	YHL015W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms