RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W RRN9P53437 365 aa7.62□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W YMR317WQ04893 1140 aa7.62□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W NNT1Q05874 261 aa7.62□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W UIP4Q08926 304 aa7.62□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W RPL39P04650 51 aa7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W ECM8P38246 354 aa7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W RPS20P38701 121 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W LOH1P47055 219 aa7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W RMD9P53140 646 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W YNR064CP53750 290 aa7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W NUP49Q02199 472 aa7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W ABZ2Q03266 374 aa7.61□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W COX5BP00425 151 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W PCL1P24867 279 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W CDC3P32457 520 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W DAL3P32459 195 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W BNA2P47125 453 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W GEP7P53171 287 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W RSM23Q01163 450 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W YDC1Q02896 317 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W MSS11Q03825 758 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W SPC19Q03954 165 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W YLR108CQ12259 485 aa7.6□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W RPC40P07703 335 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W RPC82P32349 654 aa7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W TFC1P32367 649 aa7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W PRP19P32523 503 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W SUR1P33300 382 aa7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W RTC2P38279 296 aa7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W USB1Q12208 290 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W YOL159C-AQ3E769 90 aa7.59□□□□□ -1.19
CPD1YGR247W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W GPI18P38211 433 aa7.58□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W SIC1P38634 284 aa7.58□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W LNP1P38878 278 aa7.58□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W OST1P41543 476 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W TYW3P53177 273 aa7.58□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W AIM36Q03798 255 aa7.58□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W STE18P18852 110 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W ICS2P38284 255 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W CHL4P38907 458 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W SPO73P40031 143 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W PIC2P40035 300 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W EXG2P52911 562 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W SUT1P53032 299 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W PRM8P53174 237 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W APJ1P53940 528 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W ACL4Q03771 387 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W GPI17Q04080 534 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W MLC2Q06580 163 aa7.57□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W RPS13P05756 151 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W MCH2P36032 473 aa7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W SPC34P36131 295 aa7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W YHR035WP38769 630 aa7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W PHO90P39535 881 aa7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W HMS2P47175 358 aa7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W BRE4Q07660 1125 aa7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W IRC25Q07951 179 aa7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W TY1A-BLQ12266 440 aa7.56□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data7.55□□□□□ -1.2not detected
CPD1YGR247W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W FZO1P38297 855 aa7.55□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W SFH5P47008 294 aa7.55□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W YLR126CQ12288 251 aa7.55□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W PWP1P21304 576 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W IES6P32617 166 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W RPC34P32910 317 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W YKR015CP36111 568 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W BAP2P38084 609 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W SBE22P38814 852 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W HIS6P40545 261 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W ASI3P53983 676 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W ARG5,6Q01217 863 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W DLT1Q04216 342 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W SPC24Q04477 213 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W ELP6Q04868 273 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W YPR098CQ06089 161 aa7.54□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W NAM2P11325 894 aa7.53□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W PTP2P29461 750 aa7.53□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W DEG1P31115 442 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W TAT1P38085 619 aa7.53□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W FAR7P43592 221 aa7.53□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W SRL1Q08673 210 aa7.53□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W RAX2Q12465 1220 aa7.53□□□□□ -1.2
CPD1YGR247W PHO80P20052 293 aa7.52□□□□□ -1.21
CPD1YGR247W MRPS28P21771 286 aa7.52□□□□□ -1.21
CPD1YGR247W YCL002CP25565 263 aa7.52□□□□□ -1.21
CPD1YGR247W APE2P32454 952 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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