RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 APOL6Q9BWW8 343 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 KANSL3Q9P2N6 904 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 MYO10Q9HD67 2058 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 LOC730098B7Z3J9 87 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 CTSAP10619 480 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.625e-8■■■□□ 19.2
PPP4C-212ENST00000567828 MLH1P40692 756 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 CASP10Q92851 521 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 ZFP42Q96MM3 310 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 CDH22Q9UJ99 828 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 ARL5CA6NH57 179 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 PRR33A8MZF0 331 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 ECM1Q16610 540 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 BSNDQ8WZ55 320 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 GAD1Q99259 594 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 NRP1O14786 923 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 ST18O60284 1047 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 NPTXRO95502 500 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 SCNN1GP51170 649 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 SLC27A1Q6PCB7 646 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 PADI6Q6TGC4 694 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 IRAK3Q9Y616 596 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 ALDH2P05091 517 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 PTGDRQ13258 359 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 PTPN14Q15678 1187 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 MIOSQ9NXC5 875 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 WDFY4Q6ZS81 3184 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF318Q5VUA4 2279 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 INPPL1O15357 1258 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 EPCAMP16422 314 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 SP100P23497 879 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 AKAP5P24588 427 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 OR1G1P47890 313 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 MARCH5Q9NX47 278 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1B0GUA9 196 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 CYP11B2P19099 503 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 MUTP22033 750 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 GIT2Q14161 759 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 HACE1Q8IYU2 909 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 TMX3Q96JJ7 454 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 POLD4Q9HCU8 107 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 TTLL13PA6NNM8 815 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 F8W810 466 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 DSC1Q08554 894 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 MCTP1Q6DN14 999 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 FZD8Q9H461 694 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 KLK14Q9P0G3 267 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA1024Q9UPX6 916 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 KIF3AQ9Y496 699 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 MUC6Q6W4X9 2439 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 PP2D1A8MPX8 630 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 EDN1P05305 212 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 PDIA5Q14554 519 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 FAM187BQ17R55 369 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 CES5AQ6NT32 575 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 KANK3Q6NY19 840 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 SLC22A17Q8WUG5 538 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 DZANK1Q9NVP4 752 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 STK39Q9UEW8 545 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-212ENST00000567828 PARP2Q9UGN5 583 aa25.11■■□□□ 1.61
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