RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 SPATA24Q86W54 205 aa6□□□□□ -1.45
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CAPN3-211ENST00000562199 FAM186BQ8IYM0 893 aa6□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 DTWD1Q8N5C7 304 aa6□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 SPATA5Q8NB90 893 aa6□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 BBOF1Q8ND07 529 aa6□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 IL17RDQ8NFM7 739 aa6□□□□□ -1.45
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CAPN3-211ENST00000562199 MPHOSPH8Q99549 860 aa6□□□□□ -1.45
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CAPN3-211ENST00000562199 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 NEBLO76041 1014 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPN3-211ENST00000562199 HSPA4LO95757 839 aa5.98□□□□□ -1.45
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