RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RACK1-231	ENST00000514183	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RACK1-231	ENST00000514183	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RACK1-231	ENST00000514183	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RACK1-231	ENST00000514183	TLE6	Q9H808	572 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RACK1-231	ENST00000514183	RMND1	Q9NWS8	449 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RACK1-231	ENST00000514183	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RACK1-231	ENST00000514183	USP34	Q70CQ2	3546 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	FAM86B1	E9PN63	330 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ENPP3	O14638	875 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	TBX3	O15119	743 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	TREH	O43280	583 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	RNF40	O75150	1001 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	TBX10	O75333	385 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	MYL1	P05976	194 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	NBL1	P41271	181 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ID4	P47928	161 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	MTMR3	Q13615	1198 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	SPC24	Q8NBT2	197 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	LENG9	Q96B70	501 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	BORCS6	Q96GS4	357 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	STK17A	Q9UEE5	414 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	MYO10	Q9HD67	2058 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CACNA1A	O00555	2505 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	MSH4	O15457	936 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	SLC26A4	O43511	780 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CTSH	P09668	335 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CDC25B	P30305	580 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	NRIP1	P48552	1158 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CLCN5	P51795	746 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	PGM5	Q15124	567 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	TCTN1	Q2MV58	587 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CES5A	Q6NT32	575 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	NLRX1	Q86UT6	975 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	DRC7	Q8IY82	874 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	NME8	Q8N427	588 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ERMN	Q8TAM6	284 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	POF1B	Q8WVV4	589 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	RAD54L	Q92698	747 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	WNT8B	Q93098	351 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	FAM20A	Q96MK3	541 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	LZTS1	Q9Y250	596 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CFAP54	Q96N23	3096 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	C5orf42	Q9H799	3197 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ESPN	B1AK53	854 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	MAFG	O15525	162 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	KLRC4	O43908	158 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ATP1A3	P13637	1013 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ASIC1	P78348	528 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	FANCC	Q00597	558 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	AMPD3	Q01432	767 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ITIH3	Q06033	890 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	KCNB1	Q14721	858 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ECM1	Q16610	540 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	CEP55	Q53EZ4	464 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	HYI	Q5T013	277 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23

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