RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	BICD1	Q96G01	975 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	AGPAT1	Q99943	283 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP2A1	O14983	1001 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	GYG2	O15488	501 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FMO5	P49326	533 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DYNLT1	P63172	113 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	10.51	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NTSR2	O95665	410 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SKI	P12755	728 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP4A	P20648	1035 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SERPINB4	P48594	390 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CDR2	Q01850	454 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DUPD1	Q68J44	220 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PGM2	Q96G03	612 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RILP	Q96NA2	401 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	EMSY	Q7Z589	1322 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DPPA5	A6NC42	116 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SBK1	Q52WX2	424 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PASD1	Q8IV76	773 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PRELID2	Q8N945	189 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FGD4	Q96M96	766 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RARG	P13631	454 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CHKA	P35790	457 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SPARCL1	Q14515	664 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PFAS	O15067	1338 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCB11	O95342	1321 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	C5orf60	A6NFR6	353 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	IRX4	P78413	519 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RCN1	Q15293	331 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MAML1	Q92585	1016 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC35C1	Q96A29	364 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC17	Q96AE7	1141 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TLCD1	Q96CP7	247 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MTMR9	Q96QG7	549 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	STK33	Q9BYT3	514 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	GAS7	O60861	476 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KIT	P10721	976 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNA3	P22001	575 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	JDP2	Q8WYK2	163 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	STOML1	Q9UBI4	398 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SORBS3	O60504	671 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CAMTA2	O94983	1202 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	HSPA6	P17066	643 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	GIT2	Q14161	759 aa		10.49	□□□□□ -0.73

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