RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGBD1	Q96JS3	809 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL20A1	Q9P218	1284 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	FEM1B	Q9UK73	627 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	RLF	Q13129	1914 aa		7.03	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		7.02	□□□□□ -1.28
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFIB	O00712	420 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSTN	O14793	375 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLOT1	O75955	427 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	F13B	P05160	661 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM87A	P0C7U9	286 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP2C8	P10632	490 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAT2	P52630	851 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP14	P54578	494 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUCB2	P80303	420 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAP1	Q01518	475 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	DOC2B	Q14184	412 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP2R5E	Q16537	467 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDR2	Q16832	855 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	LBX2	Q6XYB7	198 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM160B2	Q86V87	743 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC6A18	Q96N87	628 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP28	Q96RU2	1077 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH2D4A	Q9H788	454 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		7.02	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ESYT2	A0FGR8	921 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMCO2	A6NFE2	343 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ICAM1	P05362	532 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GBP1	P32455	592 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ETV3	P41162	512 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAPC2	Q13487	334 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	COG2	Q14746	738 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPA	Q15257	358 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FXN	Q16595	210 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL15	Q16663	113 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	USH1G	Q495M9	461 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	RGMB	Q6NW40	437 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDH24	Q86UP0	819 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	BLID	Q8IZY5	108 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF141	Q8WVD5	230 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGD4	Q96M96	766 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLIC4	Q9Y696	253 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASTN1	O14525	1302 aa		7.01	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDHX	O00330	501 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP2A1	O14983	1001 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSC2	O15499	205 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYRK3	O43781	588 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC3A	O75596	197 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV1-40	P01703	118 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHA1	P01876	353 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FST	P19883	344 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDC	P20941	246 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAPA	P54920	295 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLRP5	P59047	1200 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	HERVK_113	P62684	666 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GHRHR	Q02643	423 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIN1	Q05586	938 aa		7	□□□□□ -1.29
RABGGTB-212	ENST00000491266	FSTL1	Q12841	308 aa		7	□□□□□ -1.29

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