RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474707.1

RABGAP1-208, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, human

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGAP1-208	ENST00000474707	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	RASA3	Q14644	834 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ZNF174	Q15697	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	APOL3	O95236	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	LY86	O95711	162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MPL	P40238	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707		B4E1Z4	1266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SPDEF	O95238	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SLC9A1	P19634	815 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	NHLH1	Q02575	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MPP3	Q13368	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	IKBKB	O14920	756 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MATN4	O95460	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	DUSP2	Q05923	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MAST3	O60307	1309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PCDH8	O95206	1070 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	IGFALS	P35858	605 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SERINC3	Q13530	473 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RABGAP1-208	ENST00000474707	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	SCAP	Q12770	1279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	DDB1	Q16531	1140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707		A0A1W2PR48	441 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	CBX4	O00257	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	C1QL1	O75973	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	RBP3	P10745	1247 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	ITGAM	P11215	1152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	REST	Q13127	1097 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RABGAP1-208	ENST00000474707	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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