RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 CHRNA3P32297 505 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PGM1P36871 562 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 COPS2P61201 443 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 MORF4L2Q15014 288 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 RASSF3Q86WH2 238 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SPP2Q13103 211 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 DACH2Q96NX9 599 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 TTC25Q96NG3 672 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PNMA3Q9UL41 463 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRU-204ENST00000428026 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CUL3Q13618 768 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CAV1Q03135 178 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF233A6NK53 670 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NMT2O60551 498 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 NTSR2O95665 410 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FCER1AP12319 257 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TAC1P20366 129 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 MXD3Q9BW11 206 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SEC24CP53992 1094 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 RAD54LQ92698 747 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SNX12Q9UMY4 172 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CATSPER3Q86XQ3 398 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SNF8Q96H20 258 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SCARF1Q14162 830 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM270Q6UE05 265 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PALMDQ9NP74 551 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 EHD2Q9NZN4 543 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KPNA7A9QM74 516 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FLOT2Q14254 428 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SLC30A9Q6PML9 568 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CYFIP2Q96F07 1278 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 USP17L5A8MUK1 530 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 POU5F1BQ06416 359 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FAM160B2Q86V87 743 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 VPS39Q96JC1 886 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KIF2CQ99661 725 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 POTEB3A0JP26 581 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FAM187AA6NFU0 413 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 POTECB2RU33 542 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 POTEBQ6S5H4 581 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 ANKMY2Q8IV38 441 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 PROM2Q8N271 834 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KDM1AO60341 852 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 KRT17Q04695 432 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM260Q9NX78 707 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 STXBP3O00186 592 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 LONRF1Q17RB8 773 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM33Q9UPN9 1127 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms