RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220429.12

GABPB1-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1, Length 2,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-201ENST00000220429 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 STYK1Q6J9G0 422 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LRRC43Q8N309 656 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MIS12Q9H081 205 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CHN1P15882 459 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CHRNA5P30532 468 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CD97P48960 835 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SNX3O60493 162 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ATP9AO75110 1047 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SKIP12755 728 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CCNE1P24864 410 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 AMPD3Q01432 767 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 KRT71Q3SY84 523 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 RETREG2Q8NC44 543 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 P2RX5Q93086 422 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 HPS3Q969F9 1004 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ABHD8Q96I13 439 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.61□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LGALS16A8MUM7 142 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 P4HA2O15460 535 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 GSTM4Q03013 218 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SV2BQ7L1I2 683 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PNMA3Q9UL41 463 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MYMKA6NI61 221 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 RAD21O60216 631 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CYP27A1Q02318 531 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LMNB2Q03252 620 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MAP7Q14244 749 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MB21D1Q8N884 522 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 HAS1Q92839 578 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 GATA6Q92908 595 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 GJA10Q969M2 543 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MS4A14Q96JA4 679 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NYAP2Q9P242 653 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 STK17AQ9UEE5 414 aa14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 AOC3Q16853 763 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TLCD1Q96CP7 247 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CATSPER2Q96P56 530 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 KRT12Q99456 494 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MOCS3O95396 460 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ETS2P15036 469 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SLC1A4P43007 532 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MEA1Q16626 185 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SLFN13Q68D06 897 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 KCNK18Q7Z418 384 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DCAF4Q8WV16 495 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 RAB34Q9BZG1 259 aa14.59□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms