RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	APC2	Q12440	853 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	GCN4	P03069	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CYT1	P07143	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SEC12	P11655	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PPA2	P28239	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	DCG1	P32460	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	DOA4	P32571	926 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MTH1	P35198	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
RPL21B	YPL079W	YKL071W	P36086	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MRPL15	P36523	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CHK1	P38147	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YHR122W	P38829	231 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
RPL21B	YPL079W	PHO90	P39535	881 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SAM37	P50110	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YGR012W	P53206	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	FMP48	P53233	369 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	BUD25	P85052	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SNX41	Q04053	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	HEM25	Q07534	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	AIM6	Q07716	390 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MCP1	Q12106	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	FRE7	Q12333	620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SCM3	Q12334	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	BLM10	P43583	2143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	OPI3	P05375	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PRB1	P09232	635 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	HMG1	P12683	1054 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	STE12	P13574	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CTA1	P15202	515 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	STF2	P16965	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	NFS1	P25374	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PAU2	P32612	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MTC7	P32633	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	VPS17	P32913	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	NIC96	P34077	839 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CCZ1	P38273	704 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YBR242W	P38331	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YHR180W	P38868	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	CAT5	P41735	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	BNA6	P43619	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YIP4	P53093	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TDA1	Q03533	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SPC19	Q03954	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	GAS2	Q06135	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	COQ10	Q08058	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	ENB1	Q08299	606 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MDM32	Q12171	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SFG1	Q12507	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SET6	Q12529	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	COX9	P07255	59 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SGA1	P08019	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SPS2	P08459	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PCL1	P24867	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	ATS1	P31386	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MKK2	P32491	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TRS65	P32893	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	IFA38	P38286	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SDS24	P38314	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YIL060W	P40519	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PKP1	P40530	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SLS1	P42900	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	IDS2	P46958	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MNN5	P46982	586 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	LCL3	P53153	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MTL1	P53214	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YLR460C	P54007	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	TRS23	Q03784	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	RLM1	Q12224	676 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	MTR10	Q99189	972 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL21B	YPL079W	PET122	P10355	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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