RNA–Protein interactions for RNA: YMR306W

FKS3, Transcript of Protein involved in spore wall assembly, yeast

Gene FKS3, Length 5,358 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FKS3	YMR306W	THI4	P32318	326 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	APL3	P38065	1025 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ECM1	P39715	212 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	UFD1	P53044	361 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YGR016W	P53209	190 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PCP1	P53259	346 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YNR064C	P53750	290 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CSI2	Q08054	341 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	THI72	Q08579	599 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	DSF1	P0CX08	502 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YNR073C	P0CX09	502 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SUR1	P33300	382 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YHR035W	P38769	630 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TIR3	P40552	269 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	IRC7	P43623	340 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	VOA1	P53262	265 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	DAM1	P53267	343 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PRM15	Q03262	622 aa		2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PHO85	P17157	305 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MNS1	P32906	549 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	COS9	P36034	407 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YBR241C	P38142	488 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SIC1	P38634	284 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MRX1	P40050	688 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PTR3	P43606	678 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SAM50	P53969	484 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	FIN1	Q03898	291 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YDR514C	Q04408	483 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SET6	Q12529	373 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.26	□□□□□ -2.05	not detected
FKS3	YMR306W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PZF1	P39933	429 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	LOH1	P47055	219 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MRX8	Q05473	314 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YPR098C	Q06089	161 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	FSH3	Q99369	266 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	BNA2	P47125	453 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SKO1	Q02100	647 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YDC1	Q02896	317 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SNZ1	Q03148	297 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RNH1	Q04740	348 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CRT10	Q08226	957 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YOR343C	Q12484	108 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SCEI	P03882	235 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MET3	P08536	511 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PHO80	P20052	293 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YLF2	P38746	405 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CHL4	P38907	458 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CIN4	P39110	191 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YIL029C	P40538	142 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ILM1	P47155	203 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MEP3	P53390	489 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ARP10	Q04549	284 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YMR254C	Q04838	102 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RNH202	Q05635	350 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		2.26	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TPK3	P05986	398 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RPB9	P27999	122 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ISC10	P32645	267 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	GAT2	P40209	560 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MAM33	P40513	266 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	TOS2	P50078	622 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YDR102C	Q03864	110 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RFU1	Q08003	200 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	MIM1	Q08176	113 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	FCY22	Q12119	530 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	CTA1	P15202	515 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PEX32	P38292	413 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	PRE3	P38624	215 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YHL037C	P38733	133 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YHR219W	P38900	624 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SWP82	P43554	623 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	BUD9	P53226	547 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YNL046W	P53956	172 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	SED1	Q01589	338 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	YDR248C	Q03786	193 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	GAL83	Q04739	417 aa		2.25	□□□□□ -2.05
FKS3	YMR306W	AIM6	Q07716	390 aa		2.25	□□□□□ -2.05

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