RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	NUP53	Q03790	475 aa		4	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	SOR2	Q07786	357 aa		4	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YPQ1	Q12010	308 aa		4	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	NSL1	Q12143	216 aa		4	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	SFM1	Q12314	213 aa		4	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	BBP1	Q12365	385 aa		4	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	PTP1	P25044	335 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MXR2	P25566	168 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ITR2	P30606	609 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	CDC5	P32562	705 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	UPS2	P35200	230 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MOH1	P38191	138 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ATG7	P38862	630 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	SHO1	P40073	367 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	LAS21	P40367	830 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YFR020W	P43600	232 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	CHA4	P43634	648 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YJL016W	P47072	561 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MOG1	P47123	218 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	NAS6	P50086	228 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MTL1	P53214	551 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	GTR2	P53290	341 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	GND2	P53319	492 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	SED5	Q01590	340 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	TMN2	Q04562	672 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RIF2	Q06208	395 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	DXO1	Q06349	442 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YPR127W	Q06494	345 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	THP1	Q08231	455 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ENB1	Q08299	606 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RNH203	Q12338	110 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	CDC8	P00572	216 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	PET54	P10834	293 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	NAM2	P11325	894 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	URA6	P15700	204 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	PPZ2	P33329	710 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	CSG2	P35206	410 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	BMT5	P40493	336 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YFR057W	P43625	151 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MIC26	P50087	233 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	NIF3	P53081	288 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	USE1	P53146	245 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	COS6	P53344	381 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MKC7	P53379	596 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ASI1	P54074	624 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	NUP49	Q02199	472 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ABF2	Q02486	183 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	GIP3	Q03016	1276 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MSC1	Q03104	513 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	TRM82	Q03774	444 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	HSP31	Q04432	237 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	PRM6	Q04705	352 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MFG1	Q07684	458 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RFU1	Q08003	200 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	LDS2	Q08218	356 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YOR387C	Q08910	206 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	SET6	Q12529	373 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
KTR2	YKR061W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	PHO13	P19881	312 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	HSP30	P25619	332 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	STE14	P32584	239 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	TKL2	P33315	681 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	TIP20	P33891	701 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	CLG1	P35190	452 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YBR056W	P38081	501 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	RPP1	P38786	293 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	BDH1	P39714	382 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ALG8	P40351	577 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MOB1	P40484	314 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YGR201C	P42936	225 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	YGR210C	P42942	411 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	ASG7	P46993	209 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
KTR2	YKR061W	MGA1	P53050	456 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.3 ms