RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	DXO1	Q06349	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PLB3	Q08108	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	DCI1	Q08558	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PUS9	Q12069	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SUL2	Q12325	893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MSB2	P32334	1306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	HOM3	P10869	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SAC7	P17121	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	NFS1	P25374	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ADE1	P27616	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MRP17	P28778	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MSN2	P33748	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ECM15	P35195	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TUL1	P36096	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MRPL36	P36531	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ECM31	P38122	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SRO77	P38163	1010 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RRN10	P38204	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
YKR041W	YKR041W	FET3	P38993	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YEL068C	P39977	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PHB1	P40961	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PMT3	P47190	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CGR1	P53188	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SLI1	P53304	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	HHO1	P53551	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	VBA1	Q04301	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	KEI1	Q06346	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YEH1	Q07804	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CDC9	P04819	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PUT1	P09368	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	REV1	P12689	985 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CBS1	P14066	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RPB5	P20434	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PRE4	P30657	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ATS1	P31386	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	NTH1	P32356	751 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ORC2	P32833	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SFC1	P33303	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SFK1	P35735	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	THI2	P38141	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	BNA4	P38169	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	AIM2	P39721	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FMP52	P40008	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SDP1	P40479	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	BMT5	P40493	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PMT6	P42934	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SRB7	P47822	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PGA1	P53896	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	NRK1	P53915	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MTQ1	P53944	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YML053C	Q04978	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FDH1	Q08911	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SPC3	Q12133	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ERS1	P17261	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	COQ2	P32378	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YOR062C	P36025	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YHR122W	P38829	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	IKI1	P38874	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SSO2	P39926	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	YIL166C	P40445	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	QRI7	P43122	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	DOC1	P53068	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	COG7	P53195	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ASI3	P53983	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	RHO4	Q00246	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ROY1	Q04847	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	ANT1	Q06497	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	THI73	Q07904	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	RSC58	Q07979	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR041W	YKR041W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.6 ms