RNA–Protein interactions for RNA: YHL015W

RPS20, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS20, Length 366 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS20	YHL015W	PHO80	P20052	293 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YEL043W	P32618	956 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SYS1	P41544	203 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YFL064C	P43540	174 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YGL114W	P53134	725 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	OSH6	Q02201	448 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	PRR2	Q12310	699 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	LAG2	Q92325	660 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	HIS3	P06633	220 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	IFM1	P25038	676 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YIL089W	P40500	205 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YIL012W	P40551	113 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YGR168C	P53293	376 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	BIO4	P53630	237 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YPL278C	Q08990	100 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	NFI1	Q12216	726 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	GPX1	P36014	167 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	MRPL3	P36516	390 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	NRG2	P38082	220 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	MBA1	P38300	278 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	IRC4	Q03036	179 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RCF1	Q03713	159 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	NNT1	Q05874	261 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	VPS68	Q12016	184 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.88	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SCO1	P23833	295 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	IMP1	P28627	190 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YHR035W	P38769	630 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	POP2	P39008	433 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	KRE29	P40026	464 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	AVT6	P40074	448 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	PIR5	P46999	287 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YGR266W	P53326	701 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	TVP15	Q03860	143 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SNX41	Q04053	625 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SPO77	Q06134	477 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YLR446W	Q06204	433 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SUE1	Q06524	206 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YDR262W	Q12331	272 aa		0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SMI1	P32566	505 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	ZRT1	P32804	376 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	CAJ1	P39101	391 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	DAN1	P47178	298 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YDL144C	Q07589	356 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YLL007C	Q07799	665 aa		0.86	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	TPO5	P36029	618 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	MCH2	P36032	473 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YHR045W	P38775	560 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SPL2	P38839	148 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YFL040W	P43562	540 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	GAL7	P08431	366 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	COY1	P34237	679 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SIF2	P38262	535 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SUR2	P38992	349 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	INA22	P40576	216 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YFR054C	P43622	192 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YJR146W	P47174	117 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SWC4	P53201	476 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YPL150W	Q12152	901 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YPR1	Q12458	312 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	IZH4	Q99393	312 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RPS20	YHL015W	SPT7	P35177	1332 aa		0.84	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RPS20	YHL015W	YCR025C	P25352	136 aa		0.83	□□□□□ -2.28

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