RNA–Protein interactions for RNA: YDR057W

YOS9, Transcript of ER quality-control lectin, yeast

Gene YOS9, Length 1,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOS9	YDR057W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	FUB1	P25659	250 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ACH1	P32316	526 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TFA2	P36145	328 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SOL2	P37262	315 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	APL3	P38065	1025 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RCK1	P38622	512 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	BMT5	P40493	336 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YIR016W	P40572	265 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PMT4	P46971	762 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	HCH1	P53834	153 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ODC1	Q03028	310 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	NAT4	Q04751	285 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TVP18	Q04767	167 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	BNA5	Q05979	453 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RKI1	Q12189	258 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SAS5	Q99314	248 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	UFD4	P33202	1483 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	URA3	P03962	267 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MSS51	P32335	436 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SGE1	P33335	543 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	HIS2	P38635	335 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PHO90	P39535	881 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MGA1	P53050	456 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	IBD2	P53892	351 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MED7	Q08278	222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	GTT2	Q12390	233 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RIB3	Q99258	208 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	CYC3	P06182	269 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MRPL44	P19956	98 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SEC22	P22214	214 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PEX4	P29340	183 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MRP49	P32388	137 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YBR137W	P38276	179 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YHR033W	P38690	423 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ARG2	P40360	574 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YDL186W	P48568	277 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	BUD9	P53226	547 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	FMP48	P53233	369 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ATG21	Q02887	496 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	IRC10	Q08118	586 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ATP14	Q12349	124 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PRM4	Q12498	284 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	CTA1	P15202	515 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PHO80	P20052	293 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TIR2	P33890	251 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	GTS1	P40956	396 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	GAT1	P43574	510 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MIC19	P43594	170 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PMT5	P52867	743 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ERV14	P53173	138 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RSM23	Q01163	450 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SMP3	Q04174	516 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	NKP2	Q06162	153 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PLB3	Q08108	686 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	HNT3	Q08702	217 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YLL056C	Q12177	298 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YDR018C	Q12185	396 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	IZH4	Q99393	312 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SAL1	D6W196	494 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	SPS2	P08459	502 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	RPB8	P20436	146 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	SPO11	P23179	398 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	YKR051W	P36142	418 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	ARN1	P38731	627 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	YJL193W	P39542	402 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YOS9	YDR057W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42

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