RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK13O15264 365 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 ZEB2O60315 1214 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 EDN1P05305 212 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 LIG4P49917 911 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHDC9Q8NEP7 349 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNF1Q9H3M0 494 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 AKT3Q9Y243 479 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-215ENST00000628018 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.958e-17■□□□□ 10.3
CAPNS1-215ENST00000628018 MSCO60682 206 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CST5P28325 142 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXC8P31273 242 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF8P60827 252 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 HIC1Q14526 733 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC8AQ8IWT6 810 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC150Q8NCX0 1101 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP7D2Q96T17 732 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 INHAP05111 366 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNH2Q12809 1159 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SYCP1Q15431 976 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 POMGNT1Q8WZA1 660 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35C1Q96A29 364 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL18Q96ME1 805 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT122Q9HBG6 1241 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 USP20Q9Y2K6 914 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM17Q9Y577 477 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 VTNP04004 478 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GRK4P32298 578 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK6Q16659 721 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL17Q6UXB2 119 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ZPBP2Q6X784 338 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 RDH13Q8NBN7 331 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD8Q9H461 694 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 AFPP02771 609 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GYPCP04921 128 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKCBP05771 671 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PHKA2P46019 1235 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MBTD1Q05BQ5 628 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM14Q14142 442 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SLFN12LQ6IEE8 588 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SIK3Q9Y2K2 1263 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WZ62 844 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GPC3P51654 580 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 RBL2Q08999 1139 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 BFSP1Q12934 665 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PPFIBP1Q86W92 1011 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC155Q8N6L0 562 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf31Q8N865 590 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 WBP1LQ9NX94 342 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8IPA6NC78 632 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8JA6NMD2 632 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ACKR2O00590 384 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2C9P11712 490 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 LRMPQ12912 555 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNA10Q16322 511 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TCERG1LQ5VWI1 586 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GPD1LQ8N335 351 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TC2NQ8N9U0 490 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SAAL1Q96ER3 474 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 HAPLN2Q9GZV7 340 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MINDY3Q9H8M7 445 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLL13PA6NNM8 815 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TREHO43280 583 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ASGR1P07306 291 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 GNAT1P11488 350 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 KLK7P49862 253 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC42EP1Q00587 391 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNMA1Q12791 1236 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 RUFY4Q6ZNE9 571 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF410Q86VK4 478 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CBWD2Q8IUF1 395 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP58Q9BVL2 599 aa27.15■■□□□ 1.94
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